17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3962 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3962  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
296 aa  585  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2126  hypothetical protein  32.09 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000968167 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18970  hypothetical protein  27.17 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285322  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35750  hypothetical protein  31.65 
 
 
362 aa  60.1  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246678  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  28.97 
 
 
3242 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5160  hypothetical protein  32.33 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5249  hypothetical protein  32.33 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5541  hypothetical protein  32.33 
 
 
244 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2366  hypothetical protein  40.85 
 
 
382 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.18293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  56.1 
 
 
812 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  21.95 
 
 
3333 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  24.71 
 
 
3393 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  24.71 
 
 
3486 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.21 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3267  hypothetical protein  29.63 
 
 
537 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  26.88 
 
 
3392 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2455  hypothetical protein  26.6 
 
 
348 aa  43.1  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.927217  decreased coverage  0.005432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>