99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0514 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0514  protein of unknown function DUF307  100 
 
 
140 aa  267  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00567512  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1180  protein of unknown function DUF307  68.7 
 
 
132 aa  186  7e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00716366  normal  0.222129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10870  predicted membrane protein  66.92 
 
 
130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3753  hypothetical protein  67.69 
 
 
133 aa  174  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4859  hypothetical protein  67.46 
 
 
134 aa  170  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364473  normal  0.0937936 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4563  hypothetical protein  67.46 
 
 
134 aa  170  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.034177 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4476  hypothetical protein  67.46 
 
 
134 aa  170  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.503682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8707  protein of unknown function DUF307  64.12 
 
 
133 aa  168  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.184827  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6693  protein of unknown function DUF307  64.62 
 
 
132 aa  167  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175061 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1698  protein of unknown function DUF307  64.8 
 
 
126 aa  164  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.888972  hitchhiker  0.00956065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6422  hypothetical protein  62.9 
 
 
136 aa  164  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174241  normal  0.798196 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10887  hypothetical protein  62.79 
 
 
129 aa  162  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.51401e-20  normal  0.214665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0764  protein of unknown function DUF307  63.93 
 
 
123 aa  162  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3487  hypothetical protein  63.64 
 
 
133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0476  protein of unknown function DUF307  64.29 
 
 
124 aa  161  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5046  hypothetical protein  63.2 
 
 
136 aa  161  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1882  hypothetical protein  58.65 
 
 
135 aa  157  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0376  hypothetical protein  57.94 
 
 
134 aa  157  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4171  protein of unknown function DUF307  63.93 
 
 
133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.974051  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4052  protein of unknown function DUF307  55.97 
 
 
135 aa  150  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.502353  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06560  predicted membrane protein  58.33 
 
 
139 aa  150  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.289345  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1706  hypothetical protein  63.2 
 
 
135 aa  147  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2377  protein of unknown function DUF307  58.54 
 
 
123 aa  146  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0104  protein of unknown function DUF307  62.31 
 
 
131 aa  146  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0766582  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2804  protein of unknown function DUF307  56.25 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219169  normal  0.220669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0205  hypothetical protein  51.61 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34090  predicted membrane protein  53.66 
 
 
123 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237199  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1934  protein of unknown function DUF307  57.85 
 
 
129 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00173836  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0233  hypothetical protein  53.66 
 
 
126 aa  137  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0191  hypothetical protein  44.44 
 
 
143 aa  114  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1374  hypothetical protein  46.21 
 
 
150 aa  113  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.422006  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2147  hypothetical protein  44.78 
 
 
135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1525  protein of unknown function DUF307  48.44 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2330  hypothetical protein  45.52 
 
 
135 aa  110  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2641  hypothetical protein  45.52 
 
 
135 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1744  hypothetical protein  46.27 
 
 
135 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.810312  hitchhiker  0.00220396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2716  hypothetical protein  46.27 
 
 
135 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1940  hypothetical protein  43.61 
 
 
135 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00153231  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2280  hypothetical protein  45.11 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1977  hypothetical protein  45.11 
 
 
135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2322  hypothetical protein  42.86 
 
 
137 aa  108  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05283  hypothetical protein  44.96 
 
 
143 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5323  hypothetical protein  42.11 
 
 
151 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2352  hypothetical protein  44.36 
 
 
135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.363648  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2470  hypothetical protein  44.36 
 
 
135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.503038  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2681  hypothetical protein  41.35 
 
 
135 aa  107  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.95193  normal  0.733231 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1392  hypothetical protein  41.3 
 
 
152 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.526699  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1504  hypothetical protein  42.54 
 
 
134 aa  107  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.815589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1881  hypothetical protein  44.36 
 
 
135 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000585  hypothetical protein  44.19 
 
 
143 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.87989  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0842  hypothetical protein  48.89 
 
 
141 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2148  hypothetical protein  42.11 
 
 
135 aa  104  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.508072  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1575  hypothetical protein  42.75 
 
 
135 aa  103  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00720647  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0761  hypothetical protein  46.62 
 
 
134 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1838  protein of unknown function DUF307  40 
 
 
154 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.554714  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7688  hypothetical protein  43.41 
 
 
129 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0662  protein of unknown function DUF307  39.37 
 
 
135 aa  98.6  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4633  hypothetical protein  42.86 
 
 
134 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.339978  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3318  protein of unknown function DUF307  42.98 
 
 
123 aa  96.7  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2602  hypothetical protein  47.32 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0661  hypothetical protein  40 
 
 
121 aa  92.4  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.11429  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0457  hypothetical protein  43.33 
 
 
120 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000974641  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4652  hypothetical protein  45.11 
 
 
134 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6516  protein of unknown function DUF307  40.5 
 
 
122 aa  88.2  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1121  hypothetical protein  38.02 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1150  hypothetical protein  38.02 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.452098  normal  0.540601 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0680  hypothetical protein  41.59 
 
 
120 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.945663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0680  hypothetical protein  41.59 
 
 
120 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0401  protein of unknown function DUF307  44.44 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0102397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2585  hypothetical protein  42.5 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000439063  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2694  protein of unknown function DUF307  35.9 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1758  hypothetical protein  37.96 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0330869  hitchhiker  0.000134673 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0922  hypothetical protein  33.59 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1822  hypothetical protein  34.68 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204433  normal  0.65949 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1032  hypothetical protein  35.04 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00321525  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0967  protein of unknown function DUF307  37.62 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1115  hypothetical protein  35.04 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.00000000396693 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1183  hypothetical protein  35.04 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1149  hypothetical protein  35.04 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1137  hypothetical protein  35.04 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.460412  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3373  hypothetical protein  34.81 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2545  hypothetical protein  32.85 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2158  hypothetical protein  33.58 
 
 
148 aa  66.6  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000573014  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00972  hypothetical protein  33.58 
 
 
148 aa  66.6  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.026608  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2354  hypothetical protein  33.58 
 
 
148 aa  66.6  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.167767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00965  conserved inner membrane protein  33.58 
 
 
148 aa  66.6  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0139378  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2635  hypothetical protein  33.58 
 
 
148 aa  66.6  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212303  hitchhiker  0.000000348703 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1070  hypothetical protein  33.58 
 
 
148 aa  66.6  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000025348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2682  protein of unknown function DUF307  33.58 
 
 
148 aa  66.6  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1213  hypothetical protein  33.58 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2693  hypothetical protein  34.81 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2626  hypothetical protein  32.85 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.421081  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2537  hypothetical protein  32.85 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184645  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1125  hypothetical protein  32.85 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00381989  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1076  hypothetical protein  32.85 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159156  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2854  hypothetical protein  32.85 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0738745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3203  hypothetical protein  30.23 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00131337  normal  0.0664467 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1473  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  60.1  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0316981  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1439  protein of unknown function DUF307  31.01 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00732681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>