More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0562 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0562  NAD-dependent DNA ligase LigA  100 
 
 
660 aa  1322    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0449275  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  35.65 
 
 
685 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  35.36 
 
 
663 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  34.85 
 
 
673 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  36.26 
 
 
681 aa  411  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  37.65 
 
 
670 aa  412  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.83 
 
 
669 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  34.38 
 
 
666 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  35.62 
 
 
673 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3645  DNA ligase, NAD-dependent  33.23 
 
 
692 aa  389  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.57 
 
 
669 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.32 
 
 
669 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.64 
 
 
670 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.57 
 
 
669 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.57 
 
 
669 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.72 
 
 
669 aa  388  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.72 
 
 
669 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.43 
 
 
670 aa  389  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.57 
 
 
669 aa  385  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.57 
 
 
669 aa  385  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.18 
 
 
669 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.57 
 
 
669 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  34.66 
 
 
669 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1433  DNA ligase, NAD-dependent  35.68 
 
 
704 aa  382  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.95 
 
 
670 aa  381  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  33.73 
 
 
659 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  33.43 
 
 
670 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1515  NAD-dependent DNA ligase  33.98 
 
 
668 aa  379  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.872196 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.64 
 
 
669 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.19 
 
 
669 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  33.89 
 
 
665 aa  374  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  33.38 
 
 
672 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.33 
 
 
676 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  33.72 
 
 
675 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  34.64 
 
 
662 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  33.33 
 
 
691 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  34.22 
 
 
673 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1776  DNA ligase, NAD-dependent  33.13 
 
 
677 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19429  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.33 
 
 
673 aa  375  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1084  NAD-dependent DNA ligase LigA  32.35 
 
 
700 aa  372  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.419808  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  34.29 
 
 
690 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  33.43 
 
 
661 aa  375  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  34.81 
 
 
670 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  34.29 
 
 
691 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3466  DNA ligase, NAD-dependent  34.38 
 
 
689 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184307  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  35.33 
 
 
662 aa  370  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3405  DNA ligase, NAD-dependent  34.03 
 
 
672 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.558724  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  33.82 
 
 
668 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  33.63 
 
 
690 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1313  DNA ligase  33.04 
 
 
670 aa  369  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.269353 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  34.14 
 
 
690 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  32.69 
 
 
673 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2461  DNA ligase, NAD-dependent  33.18 
 
 
670 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360751  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  35.57 
 
 
668 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.63 
 
 
681 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  34.82 
 
 
718 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.78 
 
 
670 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1066  DNA ligase, NAD-dependent  35.18 
 
 
709 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1554  DNA ligase, NAD-dependent  32.25 
 
 
664 aa  368  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.344764  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  33.92 
 
 
668 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  33.33 
 
 
671 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  32.25 
 
 
678 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  33.24 
 
 
708 aa  369  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3475  DNA ligase, NAD-dependent  33.58 
 
 
668 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.502596  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  34.52 
 
 
662 aa  366  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  32.99 
 
 
675 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2085  DNA ligase, NAD-dependent  31.99 
 
 
699 aa  366  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  35.27 
 
 
688 aa  369  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  35.27 
 
 
688 aa  369  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.14 
 
 
697 aa  365  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.05 
 
 
648 aa  365  1e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  33.04 
 
 
670 aa  365  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  33.82 
 
 
673 aa  365  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  32.79 
 
 
708 aa  365  2e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.78 
 
 
670 aa  365  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.78 
 
 
670 aa  365  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2628  NAD-dependent DNA ligase LigA  32.05 
 
 
693 aa  365  2e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.533906  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4035  DNA ligase, NAD-dependent  33.57 
 
 
715 aa  364  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519531  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  34.87 
 
 
674 aa  364  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  31.51 
 
 
678 aa  364  4e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  33.69 
 
 
689 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  32.89 
 
 
681 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  35.03 
 
 
671 aa  363  6e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.33 
 
 
681 aa  363  6e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  31.73 
 
 
679 aa  363  7.0000000000000005e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  33.58 
 
 
695 aa  362  9e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  33.19 
 
 
684 aa  362  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.93 
 
 
671 aa  361  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl160  DNA ligase, polydeoxyribonucleotide synthase NAD+  34.43 
 
 
666 aa  361  3e-98  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0025564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  32.11 
 
 
690 aa  361  3e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  34.67 
 
 
672 aa  360  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1738  DNA ligase (NAD(+))  34.63 
 
 
670 aa  360  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000265236  hitchhiker  0.00000000308694 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1689  DNA ligase, NAD-dependent  33.63 
 
 
668 aa  360  4e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000649064  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0696  DNA ligase, NAD-dependent  32.44 
 
 
684 aa  360  4e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  32.93 
 
 
681 aa  360  4e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  33.78 
 
 
671 aa  360  5e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.78 
 
 
671 aa  360  5e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.08 
 
 
671 aa  360  5e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.63 
 
 
671 aa  359  7e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  33.23 
 
 
667 aa  359  7e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>