More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0132 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0132  transcript cleavage factor/unknown domain fusion protein  100 
 
 		 901 aa  1798    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2695  transcript cleavage factor/unknown domain fusion protein  33.93 
 
 		 901 aa  498  1e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000565329  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0004  transcript cleavage factor/unknown domain fusion protein  24.25 
 
 		 714 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0653  putative transcript cleavage factor/TPR domain containing protein  24.09 
 
 		 735 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4032  GreA/GreB family elongation factor  23.86 
 
 		 616 aa  125  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1534  transcription elongation factor GreA  42.75 
 
 		 165 aa  111  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 161 aa  103  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 162 aa  103  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  45.9 
 
 		 156 aa  100  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  44.35 
 
 		 156 aa  100  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  44.26 
 
 		 171 aa  99  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  44.26 
 
 		 156 aa  97.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  44.26 
 
 		 156 aa  97.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  44.26 
 
 		 156 aa  97.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  42.06 
 
 		 164 aa  97.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  38.76 
 
 		 152 aa  95.9  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 		 161 aa  94.7  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  41.27 
 
 		 158 aa  94.4  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  38.76 
 
 		 157 aa  94.4  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  39.84 
 
 		 157 aa  93.6  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  38 
 
 		 161 aa  92.8  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 161 aa  93.6  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 156 aa  92.4  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  42.4 
 
 		 158 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  38 
 
 		 161 aa  92.8  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3574  transcription elongation factor GreA  37.01 
 
 		 153 aa  92.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  hitchhiker  0.00344058 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  92.4  3e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  42.4 
 
 		 158 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  34.72 
 
 		 154 aa  92  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  40.77 
 
 		 158 aa  92  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 158 aa  92  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  91.7  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 161 aa  92  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  36.3 
 
 		 203 aa  91.7  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  91.3  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  91.3  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  91.3  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  91.3  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  91.3  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  40.5 
 
 		 157 aa  91.3  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 158 aa  90.9  9e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  38.57 
 
 		 152 aa  90.5  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  37.93 
 
 		 158 aa  90.5  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  39.55 
 
 		 158 aa  90.5  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  36.88 
 
 		 160 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  36.88 
 
 		 160 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1013  transcription elongation factor GreA  42.06 
 
 		 158 aa  90.5  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.267207  normal  0.0365336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1078  transcription elongation factor GreA  42.06 
 
 		 158 aa  90.5  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.949733  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1017  transcription elongation factor GreA  42.06 
 
 		 158 aa  90.5  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  hitchhiker  0.00044331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0710  transcription elongation factor GreA  34.72 
 
 		 160 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0264242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  89.7  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  39.37 
 
 		 158 aa  90.1  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  38.73 
 
 		 158 aa  89.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  36.91 
 
 		 158 aa  89  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  36.91 
 
 		 158 aa  89  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  36.91 
 
 		 158 aa  89  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  36.17 
 
 		 160 aa  89.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1191  transcription elongation factor GreA  41.27 
 
 		 158 aa  89.4  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  36.91 
 
 		 158 aa  89  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0201  transcription elongation factor GreA  42.98 
 
 		 167 aa  89.4  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000273731  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  36.91 
 
 		 158 aa  89  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  36.91 
 
 		 158 aa  89  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  36.91 
 
 		 158 aa  89  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  36.91 
 
 		 158 aa  89  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  36.91 
 
 		 158 aa  89  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2847  transcription elongation factor GreA  41.27 
 
 		 158 aa  89.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000241028  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4722  transcription elongation factor GreA  37.6 
 
 		 160 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  35.07 
 
 		 161 aa  88.6  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  41.6 
 
 		 158 aa  88.6  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4588  transcription elongation factor GreA  37.6 
 
 		 160 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 158 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4723  transcription elongation factor GreA  37.6 
 
 		 160 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  36.55 
 
 		 158 aa  88.6  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  34.42 
 
 		 159 aa  88.2  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3402  transcription elongation factor GreA  38.19 
 
 		 153 aa  88.2  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000615218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4500  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 158 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0546  GreA/GreB family elongation factor  42.15 
 
 		 174 aa  88.2  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  40.62 
 
 		 162 aa  88.2  7e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  33.78 
 
 		 163 aa  87.8  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4190  transcription elongation factor GreA  41.46 
 
 		 158 aa  87.8  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164972  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  41.46 
 
 		 158 aa  87.8  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  39.23 
 
 		 159 aa  87.8  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  39.52 
 
 		 158 aa  87.8  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 168 aa  87.8  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2837  transcription elongation factor GreA  35.37 
 
 		 158 aa  87.8  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107078  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  34.01 
 
 		 160 aa  87.8  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3430  transcription elongation factor GreA  41.27 
 
 		 158 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910726  hitchhiker  0.000543609 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  36.72 
 
 		 157 aa  87  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3294  transcription elongation factor GreA  41.27 
 
 		 158 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00887513  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 158 aa  87.4  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1115  transcription elongation factor GreA  41.27 
 
 		 158 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.179374  hitchhiker  0.000000000961411 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  36.62 
 
 		 158 aa  87  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  39.84 
 
 		 166 aa  87.4  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  39.84 
 
 		 166 aa  87.4  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  39.84 
 
 		 166 aa  87.4  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  38.4 
 
 		 154 aa  87.4  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3252  transcription elongation factor GreA  41.27 
 
 		 158 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0358868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  35.97 
 
 		 158 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  36.3 
 
 		 159 aa  87  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  38.17 
 
 		 157 aa  87  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>