More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0100 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0100  glutamate racemase  100 
 
 		 305 aa  605  9.999999999999999e-173  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0153  glutamate racemase  33.02 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  hitchhiker  0.000846216  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0133  glutamate racemase  30.32 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00475482  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  28.64 
 
 		 277 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1453  glutamate racemase  33.5 
 
 		 267 aa  98.2  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.010969  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3782  glutamate racemase  30.32 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000154676  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  29.15 
 
 		 280 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  29.77 
 
 		 282 aa  95.5  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2339  glutamate racemase  30.73 
 
 		 265 aa  94.7  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000177868  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4769  glutamate racemase  28 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000510238  normal  0.0239463 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0199  glutamate racemase  27.75 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000337886  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  29.95 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  32.11 
 
 		 265 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  31.28 
 
 		 265 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2884  glutamate racemase  32.84 
 
 		 265 aa  92.4  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00254237  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4019  glutamate racemase  29.84 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000394018  decreased coverage  0.00413197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0143  glutamate racemase  31.38 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000547214  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4072  glutamate racemase  31.38 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.0000000000383263  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  32.81 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  30 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0193  glutamate racemase  27.45 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00438881  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1448  glutamate racemase, putative  31.58 
 
 		 271 aa  90.1  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4337  glutamate racemase  31.53 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000357145  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4201  glutamate racemase  31.22 
 
 		 285 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000637876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4508  glutamate racemase  31.22 
 
 		 285 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000739162  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0207  glutamate racemase  29.52 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4373  glutamate racemase  30.69 
 
 		 260 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000518556  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4537  glutamate racemase  28.7 
 
 		 260 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00762513  hitchhiker  0.0000000000462365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4463  glutamate racemase  30.69 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000170429  hitchhiker  0.00000000000595997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4414  glutamate racemase  31.72 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000386576  hitchhiker  0.00203904 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4460  glutamate racemase  30.69 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00398465  hitchhiker  0.000459053 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4342  glutamate racemase  30.69 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000513683  normal  0.657896 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10321  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  33 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22912  normal  0.716928 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03852  glutamate racemase  30.69 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000349509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4019  glutamate racemase  30.69 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000548786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03801  hypothetical protein  30.69 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000631879  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4453  glutamate racemase  31.18 
 
 		 262 aa  87  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114143  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5431  glutamate racemase  31.18 
 
 		 262 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000134929  normal  0.011427 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  28.96 
 
 		 268 aa  86.3  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  28.64 
 
 		 265 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4049  glutamate racemase  31.18 
 
 		 262 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000985082  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  28.57 
 
 		 268 aa  85.9  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0781  glutamate racemase  30.73 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.264959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  29.02 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  29.2 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  30.05 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  26.98 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  28.18 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1338  glutamate racemase  30.16 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537109  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1645  glutamate racemase  24.16 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4177  glutamate racemase  30.05 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000486061  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  28.64 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  30.56 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0885  glutamate racemase  28.81 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  33.69 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1245  glutamate racemase  29.7 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0181  glutamate racemase  30.05 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000024601  hitchhiker  0.0092557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0177  glutamate racemase  30.05 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000496539  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0590  glutamate racemase  27.59 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.348712  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4075  glutamate racemase  30.81 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000696712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  26.51 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  32.64 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  28.76 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  30.2 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00256  glutamate racemase  30.96 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  30.2 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  27.31 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  30.2 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  27.69 
 
 		 265 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  27.83 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  31.05 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  26.86 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  31.51 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0179  glutamate racemase  29.21 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000377093  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0629  glutamate racemase  27.75 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0139  glutamate racemase  27.46 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000684264  normal  0.0718658 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  30.2 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  30.2 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0174  glutamate racemase  29.21 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000222817  normal  0.0305567 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  30.2 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  30.2 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0055  glutamate racemase  29.26 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0124044  normal  0.0422358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3824  glutamate racemase  30.32 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0482316  normal  0.0601496 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  25.33 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  25.33 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1317  glutamate racemase  28.35 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0180  glutamate racemase  29.21 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.815538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5384  glutamate racemase  30.81 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.572623 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1760  glutamate racemase  27.07 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002158  glutamate racemase  30.77 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000004702  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  26.55 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  31.08 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  30.58 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  26.47 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1992  glutamate racemase  31.8 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2226  glutamate racemase  29.59 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2947  glutamate racemase  25.48 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22865  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  29.1 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1488  glutamate racemase  27.62 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.044045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  30.3 
 
 		 271 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>