17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_R0077 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_R0077  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0078  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0077  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00252522  normal  0.0378625 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0075  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.125809  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0060  tRNA-Met  91.14 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000113693  hitchhiker  0.00181269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0044  tRNA-Met  91.14 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00354252  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0007  tRNA-Met  91.14 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0085  tRNA-Met  92.98 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0001  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0001  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.764109  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0041  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241337  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0020  tRNA-Met  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235412  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14024  tRNA-Met  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0076  tRNA-Met  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0013  tRNA-Met  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0030  tRNA-Met  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0040  tRNA-Met  83.87 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.138957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>