9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6624 on replicon NC_008385
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6513  conjugal transfer protein TrbM  100 
 
 		 195 aa  401  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367479  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6624  conjugal transfer protein TrbM  100 
 
 		 195 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4263  conjugal transfer protein TrbM  92.82 
 
 		 194 aa  347  8e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.913263  hitchhiker  0.00445296 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6339  conjugal transfer protein TrbM  53.59 
 
 		 200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.263777 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0141  TrbM protein  39.02 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0500878  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0168  Cpp45  37.65 
 
 		 229 aa  92.4  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0280743  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0030  cpp45  36.13 
 
 		 260 aa  86.7  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0193194  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a023  TrbM mating pair formation protein-like protein  34.81 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0042  cpp45  33.73 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>