23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6262 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6262  lipase, class 3  100 
 
 		 346 aa  716    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5957  lipase class 3  95.38 
 
 		 346 aa  662    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2073  putative lipase  34.04 
 
 		 356 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2014  putative lipase  34.04 
 
 		 356 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5752  lipase class 3  30.88 
 
 		 512 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0300845  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5954  lipase class 3  28.37 
 
 		 335 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489511  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2321  lipase class 3  28.05 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3825  hypothetical protein  23.94 
 
 		 561 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5346  lipase class 3  33.91 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.113059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  41.03 
 
 		 258 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  29.79 
 
 		 240 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  28.85 
 
 		 240 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  26.56 
 
 		 240 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  24.21 
 
 		 240 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  28.72 
 
 		 240 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  28.72 
 
 		 240 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  26.04 
 
 		 240 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  28.72 
 
 		 240 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  24.21 
 
 		 240 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  28.72 
 
 		 240 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  28.72 
 
 		 240 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  34.78 
 
 		 234 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24393  predicted protein  28.57 
 
 		 694 aa  42.7  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>