15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5657 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5657  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  226  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.916756  normal  0.846643 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6405  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  226  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171939  normal  0.114545 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6030  hypothetical protein  81.36 
 
 
120 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.195946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1390  hypothetical protein  83.19 
 
 
161 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5435  hypothetical protein  81.82 
 
 
127 aa  148  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312357 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0805  hypothetical protein  73.27 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1217  hypothetical protein  73.27 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1062  hypothetical protein  73.27 
 
 
117 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0345  hypothetical protein  73.27 
 
 
117 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1226  hypothetical protein  72.28 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5443  hypothetical protein  67.35 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.600934 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1163  hypothetical protein  63 
 
 
113 aa  93.6  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5409  hypothetical protein  62.63 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.851068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1377  hypothetical protein  47.5 
 
 
116 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0565  hypothetical protein  48.75 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>