16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5654 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5654  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  280  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.568701 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6402  hypothetical protein  97.81 
 
 
175 aa  278  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.734539  normal  0.0850274 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5438  hypothetical protein  96.35 
 
 
174 aa  274  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0201025 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1387  hypothetical protein  94.89 
 
 
147 aa  266  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6442  hypothetical protein  94.89 
 
 
147 aa  266  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0116768  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1992  hypothetical protein  85.4 
 
 
164 aa  244  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.694626  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1391  hypothetical protein  85.4 
 
 
164 aa  244  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.917863  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1015  hypothetical protein  85.4 
 
 
164 aa  244  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.452531  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1303  hypothetical protein  85.4 
 
 
164 aa  244  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3173  hypothetical protein  85.4 
 
 
164 aa  244  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3045  hypothetical protein  85.4 
 
 
164 aa  244  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2279  hypothetical protein  85.4 
 
 
164 aa  244  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6033  hypothetical protein  94.89 
 
 
147 aa  243  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156702  normal  0.227762 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4389  hypothetical protein  52.67 
 
 
155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367227  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4879  hypothetical protein  63.39 
 
 
179 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.290649  normal  0.0296292 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3802  hypothetical protein  63.39 
 
 
179 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>