17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5618 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5618  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  207  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.291541 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6348  hypothetical protein  98.06 
 
 		 103 aa  204  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471374  normal  0.90556 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6064  hypothetical protein  93.2 
 
 		 103 aa  194  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224282  normal  0.0677618 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1354  hypothetical protein  92.23 
 
 		 103 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6475  hypothetical protein  92.23 
 
 		 103 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0841184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5469  hypothetical protein  85.44 
 
 		 103 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00354051 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3002  hypothetical protein  58.25 
 
 		 185 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150878  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3128  hypothetical protein  58.25 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821875  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5413  hypothetical protein  46.6 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.493412  normal  0.978722 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3798  hypothetical protein  41.75 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.422466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4265  hypothetical protein  41.75 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.20365  normal  0.142751 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1633  hypothetical protein  41.75 
 
 		 103 aa  90.1  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4386  hypothetical protein  40.78 
 
 		 103 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131192  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4236  hypothetical protein  40.78 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5969  hypothetical protein  41.18 
 
 		 174 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.907583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3981  hypothetical protein  41.18 
 
 		 174 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0894  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 		 313 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114407  normal  0.256671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>