17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5589 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5589  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  317  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304835  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6315  hypothetical protein  96.91 
 
 
162 aa  307  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.080801 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6089  hypothetical protein  80.25 
 
 
162 aa  253  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1329  hypothetical protein  78.4 
 
 
162 aa  246  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.15967  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6500  hypothetical protein  78.4 
 
 
162 aa  246  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126665  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5492  hypothetical protein  75.31 
 
 
162 aa  226  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497532  hitchhiker  0.00213158 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1881  hypothetical protein  56.44 
 
 
162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.274367  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1973  hypothetical protein  55.83 
 
 
124 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.532552  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0908  hypothetical protein  38.65 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.462728  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0672  hypothetical protein  38.32 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.459354  normal  0.726708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3082  hypothetical protein  35.03 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0507714  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1852  hypothetical protein  39.34 
 
 
123 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0187165  hitchhiker  0.0000000000367601 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1711  hypothetical protein  27.12 
 
 
104 aa  45.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2270  hypothetical protein  29.37 
 
 
116 aa  45.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.3138  hitchhiker  0.0000505019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2046  hypothetical protein  30.16 
 
 
124 aa  44.3  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0372265  normal  0.0852031 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4561  hypothetical protein  28.57 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.947681  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3432  hypothetical protein  29.37 
 
 
130 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469123  normal  0.406581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>