296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5585 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5585  MgtC/SapB transporter  100 
 
 
231 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424007  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5496  MgtC/SapB transporter  90.87 
 
 
231 aa  332  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711847 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6504  MgtC/SapB transporter  90.43 
 
 
234 aa  330  9e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.890019  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6093  MgtC/SapB transporter  90.43 
 
 
234 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1325  MgtC/SapB transporter  90 
 
 
234 aa  327  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.164051  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0407  MgtC family membrane protein  78.79 
 
 
301 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.369617  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1877  putative magnesium transporter  78.79 
 
 
305 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1969  MgtC family membrane protein  79.04 
 
 
231 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  66.96 
 
 
228 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2176  MgtC family protein  69.41 
 
 
231 aa  291  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0397  MgtC family membrane protein  68.04 
 
 
243 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1856  MgtC family protein  68.04 
 
 
231 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306879  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1748  MgtC family protein  68.04 
 
 
231 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2126  MgtC family protein  68.04 
 
 
243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0862  MgtC family protein  68.04 
 
 
243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0307  MgtC family membrane protein  68.04 
 
 
243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808223  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1150  MgtC family protein  68.04 
 
 
231 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6903  MgtC/SapB transporter  63.44 
 
 
228 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.275178 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2948  MgtC/SapB family transporter  64.32 
 
 
228 aa  275  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.349809  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3295  MgtC/SapB transporter  66.97 
 
 
231 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0387472 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5362  MgtC/SapB transporter  67.12 
 
 
232 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0134811  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5498  MgtC/SapB transporter  67.12 
 
 
232 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178344  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4773  MgtC/SapB transporter  67.12 
 
 
232 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.347441 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5378  MgtC/SapB transporter  66.67 
 
 
232 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2797  MgtC/SapB transporter  59.73 
 
 
226 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4832  MgtC/SapB transporter  65.75 
 
 
232 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0626  MgtC/SapB transporter  57.47 
 
 
219 aa  239  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473392  normal  0.489512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3009  MgtC/SapB transporter  58.11 
 
 
226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.794391  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3112  MgtC/SapB transporter  56.31 
 
 
226 aa  238  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2886  MgtC/SapB transporter  56.31 
 
 
226 aa  238  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0361104  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8016  MgtC/SapB transporter  58.41 
 
 
225 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  39.01 
 
 
225 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  38.94 
 
 
225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  38.5 
 
 
225 aa  154  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  39.64 
 
 
225 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  38.5 
 
 
225 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  38.5 
 
 
225 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  38.5 
 
 
225 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  52.82 
 
 
225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3230  MgtC/SapB transporter  38.12 
 
 
225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  39.19 
 
 
225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  53.1 
 
 
225 aa  149  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  42.08 
 
 
221 aa  148  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  42.47 
 
 
232 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  46.95 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  46.95 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  46.95 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0740  Mg2+ transporter  54.2 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0377433  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  44.38 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  49.67 
 
 
231 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  38.32 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0141  MgtC/SapB transporter  45.7 
 
 
235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  38.32 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  38.32 
 
 
215 aa  135  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  53.91 
 
 
233 aa  135  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0915905 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  38.32 
 
 
215 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  38.32 
 
 
215 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  38.32 
 
 
215 aa  135  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  38.32 
 
 
215 aa  135  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2051  MgtC/SapB transporter  40.53 
 
 
216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  37.85 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  39.51 
 
 
221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  52.08 
 
 
165 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  50 
 
 
227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1344  hypothetical protein  51.05 
 
 
245 aa  125  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.753659  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  39.44 
 
 
240 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  38.33 
 
 
240 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  34.09 
 
 
223 aa  125  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  49.32 
 
 
237 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  54.96 
 
 
133 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  54.2 
 
 
133 aa  122  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  53.44 
 
 
133 aa  122  6e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  36.61 
 
 
232 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0206  MgtC/SapB transporter  38.3 
 
 
191 aa  121  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  36.77 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  36.32 
 
 
233 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  48.95 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28060  uncharacterized membrane protein  43.55 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  38.2 
 
 
228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  37.77 
 
 
227 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1140  hypothetical protein  37.67 
 
 
244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000347629  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1155  MgtC family protein  39.41 
 
 
228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0257745  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1926  MgtC/SapB transporter  45.51 
 
 
216 aa  114  8.999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4858  MgtC/SapB transporter  46.67 
 
 
218 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891892  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  48.23 
 
 
227 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  48.2 
 
 
225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0202  MgtC/SapB transporter  44.85 
 
 
226 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1155  MgtC/SapB transporter  47.1 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100649  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  47.45 
 
 
245 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  39.58 
 
 
168 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0111  MgtC/SapB transporter  39.89 
 
 
287 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1965  putative MgtC family protein  50 
 
 
233 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0406  MgtC/SapB transporter  49.34 
 
 
249 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.452939  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1355  MgtC/SapB transporter  34.85 
 
 
238 aa  105  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.928186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4764  sapB protein  40.91 
 
 
226 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4604  MgtC/SapB family membrane protein  40.91 
 
 
226 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4626  MgtC/SapB family membrane protein  40.91 
 
 
226 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.395521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5127  sapb protein  40.91 
 
 
226 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5006  sapB protein  40.91 
 
 
226 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0921  MgtC/SapB transporter  34.34 
 
 
248 aa  103  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000837465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>