19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5108 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5108  fucose-binding lectin II  100 
 
 		 245 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00609809  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3258  fucose-binding lectin II  98.78 
 
 		 245 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000492866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2935  hypothetical protein  97.15 
 
 		 309 aa  483  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.575987  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4984  fucose-binding lectin II  92.24 
 
 		 244 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3176  fucose-binding lectin II  92.24 
 
 		 244 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00638725 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4303  fucose-binding lectin II  92.24 
 
 		 244 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.729545  normal  0.0282689 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2934  hypothetical protein  75.65 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4302  fucose-binding lectin II  72.17 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal  0.0766274 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4983  fucose-binding lectin II  71.3 
 
 		 272 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3177  fucose-binding lectin II  71.3 
 
 		 272 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0525996 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3288  hypothetical protein  54.39 
 
 		 114 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1769  fucose-binding lectin PA-IIL  50.44 
 
 		 115 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20610  fucose-binding lectin PA-IIL  47.79 
 
 		 115 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000165307  normal  0.65706 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7213  hypothetical protein  39.19 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2933  hypothetical protein  41.6 
 
 		 129 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.706897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4301  fucose-binding lectin II  40.98 
 
 		 129 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.886419  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3178  fucose-binding lectin II  40.98 
 
 		 129 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4982  hypothetical protein  40.98 
 
 		 129 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3259  fucose-binding lectin II  40.98 
 
 		 129 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0014787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>