22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4980 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4980  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  303  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411596  normal  0.591894 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3123  hypothetical protein  98.7 
 
 		 154 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.862887 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5314  hypothetical protein  86.36 
 
 		 154 aa  248  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5148  hypothetical protein  90.91 
 
 		 154 aa  246  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.426334  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5711  hypothetical protein  90.91 
 
 		 154 aa  246  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0707183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3169  hypothetical protein  90.26 
 
 		 166 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4528  hypothetical protein  89.61 
 
 		 154 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0019  hypothetical protein  64.94 
 
 		 177 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1165  hypothetical protein  64.94 
 
 		 177 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1445  hypothetical protein  64.94 
 
 		 177 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.280213  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0021  hypothetical protein  64.94 
 
 		 177 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0019  hypothetical protein  64.94 
 
 		 177 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0017  hypothetical protein  65.19 
 
 		 135 aa  164  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0015  hypothetical protein  64.44 
 
 		 135 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1522  hypothetical protein  64.44 
 
 		 135 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1774  putative signal peptide transmembrane protein  39.61 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1573  putative signal peptide transmembrane protein  38.96 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2910  putative signal peptide transmembrane protein  40.26 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1345  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337158  normal  0.0274003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1409  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000519507  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5305  hypothetical protein  30.86 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165868  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5582  hypothetical protein  27.14 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>