29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4350 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4350  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  223  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000333846 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4866  hypothetical protein  98.15 
 
 		 108 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373863  hitchhiker  0.000131644 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5371  hypothetical protein  96.3 
 
 		 108 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.059612  normal  0.0608107 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3451  hypothetical protein  96.3 
 
 		 108 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.22431  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4915  hypothetical protein  96.3 
 
 		 108 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424589  normal  0.380404 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0776  hypothetical protein  93.52 
 
 		 108 aa  213  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43126  normal  0.0318592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3697  hypothetical protein  87.04 
 
 		 108 aa  202  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.571902  normal  0.383858 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2212  hypothetical protein  70.37 
 
 		 108 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00311977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0870  putative immunity protein  70.37 
 
 		 108 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0962  putative immunity protein  70.37 
 
 		 108 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.116631  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0833  putative immunity protein  67.86 
 
 		 112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1567  putative immunity protein  67.86 
 
 		 112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0224481  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0053  putative immunity protein  67.86 
 
 		 112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.013055  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1762  immunity protein, putative  72.22 
 
 		 108 aa  153  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0454984  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5458  hypothetical protein  51 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5275  hypothetical protein  51.06 
 
 		 102 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124042  normal  0.0618607 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1149  hypothetical protein  53.19 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5534  putative signal peptide transmembrane protein  39.39 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089855 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6998  putative signal peptide transmembrane protein  44.64 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2874  putative signal peptide transmembrane protein  44.64 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4104  hypothetical protein  46.67 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1348  hypothetical protein  37.78 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.195078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1576  immunity protein, putative  40.82 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_42  hypothetical protein  41.3 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000133403  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1622  hypothetical protein  34 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.877447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3368  hypothetical protein  36.67 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0039  hypothetical protein  39.13 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4324  hypothetical protein  37.1 
 
 		 193 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1591  hypothetical protein  36.54 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000431403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>