18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3231 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3760  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703241  hitchhiker  0.00130051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3231  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531201  normal  0.0645002 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4882  hypothetical protein  93.1 
 
 		 58 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136917  hitchhiker  0.00145502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2233  hypothetical protein  89.66 
 
 		 58 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223216  normal  0.27582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4501  hypothetical protein  89.66 
 
 		 58 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0584881  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3863  hypothetical protein  89.66 
 
 		 58 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0392058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3664  hypothetical protein  89.66 
 
 		 58 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0561841  normal  0.750384 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2845  hypothetical protein  71.15 
 
 		 59 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0350993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1677  hypothetical protein  74.51 
 
 		 52 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6801  hypothetical protein  71.15 
 
 		 58 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0122281  decreased coverage  0.0000000557857 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0333  hypothetical protein  74.51 
 
 		 52 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383813  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2424  hypothetical protein  74.51 
 
 		 52 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2561  hypothetical protein  74.51 
 
 		 52 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0302  hypothetical protein  74.51 
 
 		 52 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400973  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1481  hypothetical protein  74.51 
 
 		 52 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.224483  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0596  hypothetical protein  74.51 
 
 		 52 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0864  hypothetical protein  74.51 
 
 		 52 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.219242  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4408  hypothetical protein  67.31 
 
 		 58 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75876  normal  0.436644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>