18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2955 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_2955  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2818  hypothetical protein  97.5 
 
 
80 aa  146  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311887  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2292  hypothetical protein  80 
 
 
80 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.531874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2906  hypothetical protein  80 
 
 
80 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0227633  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2921  hypothetical protein  80 
 
 
80 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.668286 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6249  hypothetical protein  80 
 
 
80 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0398  hypothetical protein  70.89 
 
 
81 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal  0.0143149 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0368  hypothetical protein  66.23 
 
 
133 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102653  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0071  hypothetical protein  68 
 
 
140 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0237  hypothetical protein  68 
 
 
142 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1356  hypothetical protein  68 
 
 
142 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155509  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3206  hypothetical protein  68 
 
 
142 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0445  hypothetical protein  68.57 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0608  hypothetical protein  68.57 
 
 
140 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0426  hypothetical protein  68.57 
 
 
140 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.343189  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4228  hypothetical protein  62.03 
 
 
79 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.198207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0488  hypothetical protein  60.76 
 
 
79 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0326515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0202  hypothetical protein  53.97 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>