76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0164 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0177  transcriptional activator FlhD  100 
 
 		 106 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0164  transcriptional activator FlhD  100 
 
 		 106 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0233  transcriptional activator FlhD  95.28 
 
 		 106 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0251  transcriptional activator FlhD  95.28 
 
 		 106 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.272969  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3353  transcriptional activator FlhD  95.28 
 
 		 106 aa  204  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719466  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0160  transcriptional activator FlhD  94.34 
 
 		 106 aa  202  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2856  transcriptional activator FlhD  94.34 
 
 		 106 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17963  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0082  transcriptional activator FlhD  91.51 
 
 		 222 aa  199  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3440  transcriptional activator FlhD  90.57 
 
 		 222 aa  197  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2864  transcriptional activator FlhD  90.57 
 
 		 106 aa  197  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1679  transcriptional activator FlhD  90.57 
 
 		 106 aa  197  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.614234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3111  transcriptional activator FlhD  90.57 
 
 		 106 aa  197  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3941  transcriptional activator FlhD  90.57 
 
 		 106 aa  197  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.922681  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3860  transcriptional activator FlhD  90.57 
 
 		 106 aa  197  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3187  transcriptional activator FlhD  90.57 
 
 		 106 aa  196  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0821946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0114  transcriptional activator FlhD  81.9 
 
 		 106 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3820  transcriptional activator FlhD  83.5 
 
 		 106 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.173639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2979  transcriptional activator FlhD  79.05 
 
 		 106 aa  177  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000641215 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3685  transcriptional activator FlhD  63.73 
 
 		 105 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0479356 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5604  transcriptional activator FlhD  63.73 
 
 		 105 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.231239  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4639  transcriptional activator FlhD  61.17 
 
 		 106 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187238  normal  0.541789 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0858  transcriptional activator FlhD  60.19 
 
 		 106 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0428294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4544  transcriptional activator FlhD  60.19 
 
 		 106 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7083  transcriptional activator FlhD  56.44 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1943  transcriptional activator FlhD  52 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1292  transcriptional activator FlhD  47.27 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000962983  hitchhiker  0.0000000541956 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1988  transcriptional activator FlhD  47.27 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.83852e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2125  transcriptional activator FlhD  47.27 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000669135  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1740  transcriptional activator FlhD  47.27 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.140551  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1748  flagellar transcriptional activator  47.27 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00200339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01852  hypothetical protein  47.27 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4160  flagellar transcriptional activator  48.04 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01863  transcriptional activator FlhD  47.27 
 
 		 119 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0964972  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1305  transcriptional activator FlhD  46.53 
 
 		 105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2086  transcriptional activator FlhD  48.04 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000128662  unclonable  1.32042e-30 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1319  transcriptional activator FlhD  48.04 
 
 		 116 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102407  hitchhiker  1.2450300000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1196  transcriptional activator FlhD  48.04 
 
 		 116 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000242904  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2081  transcriptional activator FlhD  48.04 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000102122  decreased coverage  0.000000325963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2141  transcriptional activator FlhD  48.04 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000294408  hitchhiker  1.8448199999999999e-31 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2631  transcriptional activator FlhD  47.27 
 
 		 116 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000042575  decreased coverage  0.00000000000000177734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2470  transcriptional activator FlhD  50.53 
 
 		 119 aa  107  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000162206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1536  transcriptional activator FlhD  46.6 
 
 		 116 aa  107  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00409913  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1508  transcriptional activator FlhD  48.98 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00168962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2989  transcriptional activator FlhD  46.6 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4155  transcriptional activator FlhD  47.06 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4043  transcriptional activator FlhD  47.06 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1851  transcriptional activator FlhD  50.54 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00649887  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1413  transcriptional activator FlhD  47.06 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526559 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1240  transcriptional activator FlhD  48 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2615  transcriptional activator FlhD  50.54 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00174492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1634  transcriptional activator FlhD  49.46 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1745  transcriptional activator FlhD  49.46 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0465343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3700  flagellar transcriptional activator FlhD  48.08 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1690  flagellar transcriptional activator  47.92 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1005  flagellar transcriptional activator  45.19 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2869  transcriptional regulator  45.19 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0151  flagellar transcriptional activator  44.23 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2884  flagellar transcriptional activator, FlhD subunit  47.17 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0514337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2371  flagellar transcriptional activator  46.23 
 
 		 109 aa  92  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.290285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2006  flagellar transcriptional activator, FlhD subunit  45.28 
 
 		 109 aa  91.3  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0823929  hitchhiker  0.00228476 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4211  transcriptional activator FlhD  42.72 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1860  flagellar transcriptional activator, FlhD subunit  41.82 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.309366  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2028  putative flagellar transcriptional activator transcription regulator protein  39.58 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00113086  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2236  flagellar transcriptional activator  43.14 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489857  normal  0.0382615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24300  flagellar transcriptional activator  41.76 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.757302  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3229  flagellar transcriptional activator  39.76 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7665  transcriptional activator FlhD  40.45 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1513  flagellar transcriptional activator  43.75 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5178  flagellar transcriptional activator  43.75 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5921  putative flagellar transcriptional activator FlhD  40.58 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.866617  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7384  hypothetical protein  37.84 
 
 		 77 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6190  putative flagellar transcriptional activator FlhD  39.13 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.188965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1364  flagellar transcriptional activator FlhD  39.44 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.380478  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3260  regulator of flagellar biosynthesis FlhD  38.03 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3246  FlhD family protein  38.03 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.583715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3208  FlhD family protein  38.03 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>