51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6592 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6592  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  220  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02142  remnant of a transposase gene protein  75 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.965684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5759  putative remnant of a transposase gene protein  93.75 
 
 		 57 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06216  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  70 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06099  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  70 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05425  integrase core domain, putative  70 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04612  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  70 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.809805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04105  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  70 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03801  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  70 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03339  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  70 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03016  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  70 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01854  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  70 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01834  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  70 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.878416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01211  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  70 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00950  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  70 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00937  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  70 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  62.5 
 
 		 343 aa  54.3  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03433  ISXoo15 transposase  58.97 
 
 		 315 aa  51.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  61.54 
 
 		 343 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  53.85 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01165  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  73.33 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.632104  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  53.85 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  53.85 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  53.85 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  37.33 
 
 		 339 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  53.85 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  53.85 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  53.85 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  53.85 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  53.85 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 386 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  51.16 
 
 		 356 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  51.16 
 
 		 356 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  45.24 
 
 		 386 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  51.28 
 
 		 339 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  51.28 
 
 		 339 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  51.28 
 
 		 339 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7355  IS30 family transposase  45.24 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.364486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  55.26 
 
 		 466 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  40.48 
 
 		 342 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2136  diguanylate phosphodiesterase  55.88 
 
 		 292 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2294  integrase catalytic region  53.85 
 
 		 316 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  45 
 
 		 386 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  61.11 
 
 		 618 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  40.48 
 
 		 386 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 386 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 386 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 386 aa  40.8  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  51.28 
 
 		 385 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  51.28 
 
 		 385 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  52.94 
 
 		 326 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>