39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6581 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6581    100 
 
 		 96 bp  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0700613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  95.7 
 
 		 366 bp  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  95.7 
 
 		 366 bp  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  95.7 
 
 		 366 bp  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  95.7 
 
 		 366 bp  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  95.7 
 
 		 366 bp  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  95.7 
 
 		 366 bp  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2332  ISRSO10-transposase ORFA protein  88.89 
 
 		 267 bp  99.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  88.89 
 
 		 369 bp  99.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  88.89 
 
 		 369 bp  99.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  88.89 
 
 		 369 bp  99.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  88.89 
 
 		 366 bp  99.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1453  transposase  95 
 
 		 888 bp  63.9  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2744  transposase  95 
 
 		 888 bp  63.9  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.936564  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2584  transposase  95 
 
 		 888 bp  63.9  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1536  transposase  95 
 
 		 888 bp  63.9  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0366  transposase  95 
 
 		 888 bp  63.9  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0096  transposase  95 
 
 		 888 bp  63.9  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  85.29 
 
 		 402 bp  56  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0387    93.55 
 
 		 1229 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  93.55 
 
 		 366 bp  46.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0517    93.55 
 
 		 186 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  93.55 
 
 		 366 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  93.55 
 
 		 366 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0003    93.55 
 
 		 186 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0238    93.55 
 
 		 186 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0074    93.55 
 
 		 186 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314733  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0012    93.55 
 
 		 186 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1562    93.55 
 
 		 138 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164068 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  93.55 
 
 		 366 bp  46.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  93.55 
 
 		 366 bp  46.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  93.55 
 
 		 366 bp  46.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5964    100 
 
 		 327 bp  46.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00913301 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  93.55 
 
 		 366 bp  46.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  93.55 
 
 		 366 bp  46.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  93.55 
 
 		 366 bp  46.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  93.55 
 
 		 366 bp  46.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  93.55 
 
 		 366 bp  46.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4252  transposase IS3/IS911 family protein  89.47 
 
 		 258 bp  44.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>