21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6533 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6533  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  835    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5585  hypothetical protein  70.6 
 
 		 410 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6249  hypothetical protein  37.06 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1568  hypothetical protein  35.56 
 
 		 406 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5232  hypothetical protein  35.31 
 
 		 406 aa  239  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5361  hypothetical protein  35.44 
 
 		 409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0691141 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5030  protein of unknown function DUF1173  31.28 
 
 		 441 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5425  hypothetical protein  28.36 
 
 		 451 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4289  hypothetical protein  26.54 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4991  hypothetical protein  31.28 
 
 		 489 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  hitchhiker  0.00100031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2244  hypothetical protein  25.33 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2564  hypothetical protein  25.28 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4154  hypothetical protein  25.17 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0603844  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4238  hypothetical protein  23.77 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1564  hypothetical protein  24.77 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144406  normal  0.0475856 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6826  hypothetical protein  24.45 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0336179  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6244  hypothetical protein  23.5 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3958  hypothetical protein  24.18 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4329  hypothetical protein  24.79 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00310641  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1674  hypothetical protein  24.59 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.252915 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4748  hypothetical protein  20.67 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>