9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6505 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6505  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  497  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5610  hypothetical protein  81.09 
 
 		 320 aa  394  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1521  hypothetical protein  45.49 
 
 		 263 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5186  type IV secretory pathway, entry exclusion protein A (putative protein precursor)  45.49 
 
 		 263 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6306  hypothetical protein  42.54 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.881794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  26.61 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4748  hypothetical protein  24.77 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0055  conjugal transfer protein TrbJ  35.35 
 
 		 258 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  31.78 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>