116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6222 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6222  CreA protein, putative  100 
 
 
161 aa  326  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0065  creA protein, putative  88.2 
 
 
161 aa  288  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1146  CreA family protein  54.97 
 
 
158 aa  164  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247181  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5614  CreA family protein  48 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299882  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1356  CreA family protein  31.97 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389056  normal  0.0606126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4211  hypothetical protein  31.5 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728234  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0806  CreA family protein  31.34 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.327606 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0978  CreA family protein  33.07 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590297  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0974  CreA family protein  33.07 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1050  hypothetical protein  31.25 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013058  normal  0.385913 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0619  CreA  30.71 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000154449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1098  CreA family protein  30.71 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1057  CreA family protein  30.71 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000059839  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2934  CreA family protein  30.47 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134682  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1420  CreA family protein  32.03 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136825  normal  0.374337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1471  putative CREA signal peptide protein  31.03 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  0.156186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4041  CreA  29.87 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4747  hypothetical protein  30.88 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2205  CreA family protein  32.03 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571035  normal  0.349002 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2776  creA protein  30.08 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1829  CreA protein  30.08 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2219  CreA family protein  31.53 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.733419  normal  0.0172674 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0506  creA protein  30.08 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405365  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2935  CreA protein  30.08 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000238483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2506  creA protein  30.08 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020214  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2818  CreA protein  30.08 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000698436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2878  CreA protein  30.08 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00867181  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2016  CreA family protein  33.04 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1693  creA protein  27.89 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5711  CreA family protein  34.78 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0147337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0326  CreA  29.55 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.884281  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2794  CreA protein  34.26 
 
 
157 aa  62.4  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.610019  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0655  CreA family protein  33.33 
 
 
168 aa  61.2  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1715  CreA  34.91 
 
 
163 aa  60.5  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.842807  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0634  CreA family protein  32.71 
 
 
168 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265894  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1905  CreA  28.77 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4493  CreA family protein  28.28 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.105025  normal  0.313164 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0705  CreA  29.32 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0724  CreA family protein  30.15 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1790  CreA family protein  29.73 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3672  hypothetical protein  28.95 
 
 
160 aa  58.5  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0801  creA protein  29.6 
 
 
156 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3678  CreA family protein  30.25 
 
 
152 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40750  CreA family protein  30.25 
 
 
150 aa  57.8  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0724  CreA family protein  29.75 
 
 
153 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.0462373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0692  CreA family protein  29.75 
 
 
153 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4856  CreA  29.75 
 
 
154 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60410  hypothetical protein  32.04 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117962 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3982  CreA family protein  31.37 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5204  hypothetical protein  32.04 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146479  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0789  CreA family protein  26.88 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000658156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5569  CreA family protein  24.54 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4988  CreA family protein  31.78 
 
 
178 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109414  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3866  hypothetical protein  28.95 
 
 
160 aa  55.5  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000248157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0680  hypothetical protein  24.84 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000479478  normal  0.515655 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04273  hypothetical protein  32.71 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3600  CreA family protein  32.71 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3479  hypothetical protein  28.67 
 
 
155 aa  51.2  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04238  hypothetical protein  32.71 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4633  hypothetical protein  32.71 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4996  hypothetical protein  32.71 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0812  hypothetical protein  28.67 
 
 
155 aa  51.2  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3607  hypothetical protein  28.67 
 
 
155 aa  51.2  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3659  hypothetical protein  32.71 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4948  hypothetical protein  32.71 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4945  hypothetical protein  32.71 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5912  hypothetical protein  32.71 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2379  CreA family protein  30.3 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248608  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0558  hypothetical protein  28.68 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0569  hypothetical protein  23.31 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204427  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1237  CreA family protein  29.63 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.074293 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4945  hypothetical protein  28.8 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4997  hypothetical protein  28.8 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.820567 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4838  hypothetical protein  28.8 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4911  hypothetical protein  28.8 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4999  hypothetical protein  28.8 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0829  CreA family protein  32 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.272971  normal  0.0737603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2083  CreA  28.83 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2403  CreA family protein  27.97 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000790127  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46347  predicted protein  29.32 
 
 
255 aa  47.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.048303  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2098  CreA  34.65 
 
 
161 aa  47.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.409089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0530  hypothetical protein  26.4 
 
 
158 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0434  creA protein  26.61 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3273  CreA  28.57 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1735  CreA family protein  28.28 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5214  CreA family protein  25 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.304465 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2522  CreA family protein  33.98 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4747  CreA family protein  25 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00543414  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1824  CreA family protein  32.67 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00367873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1975  CreA family protein  33.01 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00187565  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2190  creA protein  31.68 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2205  CreA family protein  32.67 
 
 
171 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2415  CreA family protein  32.67 
 
 
171 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113844  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1836  CreA family protein  32.67 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2345  CreA  25.98 
 
 
180 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00745568  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2282  CreA family protein  32.67 
 
 
171 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84118  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1872  CreA family protein  32.67 
 
 
162 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.210491  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1640  CreA family protein  25.32 
 
 
173 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5289  CreA family protein  26.79 
 
 
181 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2453  CreA family protein  32.67 
 
 
162 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>