22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5957 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_6262  lipase, class 3  95.38 
 
 
346 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5957  lipase class 3  100 
 
 
346 aa  713    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2073  putative lipase  34.59 
 
 
356 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2014  putative lipase  34.59 
 
 
356 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5752  lipase class 3  28.95 
 
 
512 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0300845  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5954  lipase class 3  29.95 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489511  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2321  lipase class 3  31.39 
 
 
383 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3825  hypothetical protein  23.51 
 
 
561 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5346  lipase class 3  33.04 
 
 
343 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.113059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  41.03 
 
 
258 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  28.72 
 
 
240 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  27.66 
 
 
240 aa  43.1  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  27.66 
 
 
240 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  34.78 
 
 
234 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  27.66 
 
 
240 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24393  predicted protein  29.67 
 
 
694 aa  42.7  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  27.66 
 
 
240 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  27.66 
 
 
240 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  27.66 
 
 
240 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  27.66 
 
 
240 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  27.66 
 
 
240 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  27.66 
 
 
240 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>