241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5397 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5397  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 		 98 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.48701  normal  0.976542 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4850  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 		 98 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2207  H-NS histone family protein  87.76 
 
 		 96 aa  166  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000144624  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3002  H-NS histone family protein  86.73 
 
 		 96 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1239  H-NS histone family protein  86.73 
 
 		 96 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000958752  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0401  H-NS histone family protein  86.73 
 
 		 96 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000304691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2886  H-NS histone family protein  86.73 
 
 		 96 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000145694  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1739  H-NS histone family protein  86.73 
 
 		 96 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1551  H-NS histone family protein  86.73 
 
 		 96 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000358636  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3279  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  83.67 
 
 		 97 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0515948 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0365  H-NS histone family protein  85.71 
 
 		 96 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000040716  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0132  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  87.88 
 
 		 99 aa  163  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5335  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  85.15 
 
 		 101 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5527  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  85.15 
 
 		 101 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4746  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  85.15 
 
 		 101 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  65 
 
 		 97 aa  123  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  61.22 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  61.22 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00711  putative HNS-like transcription regulator protein  53.61 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000172984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3721  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  52.58 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00112888  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4798  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  52.58 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_003296  RS02004  putative HNS-like transcription regulator protein  46.88 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0969964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0867  putative HNS-like transcription regulator protein  46.88 
 
 		 96 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4935  putative H-NS histon-like DNA-binding protein  47.06 
 
 		 104 aa  93.2  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.529231  normal  0.833407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4990  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  47.12 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0212879  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5562  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  47.57 
 
 		 104 aa  90.9  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  48.45 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.42 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2867  H-NS histone family protein  44.33 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0084  H-NS histone family protein  44.33 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1677  H-NS histone family protein  44.33 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3109  H-NS histone family protein  44.33 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3442  H-NS histone family protein  44.33 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3943  H-NS histone family protein  44.33 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.11 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3862  H-NS histone family protein  44.33 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.55 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521264  normal  0.418842 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6005  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  43.56 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4689  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.98 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0265  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.55 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3806  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.48 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0101066  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6929  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.599841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6084  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.47 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6382  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  46.46 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193522  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2981  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.33 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207499  decreased coverage  0.0000000417224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0838  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.24 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3154  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  42 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5214  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1636  H-NS histone family protein  38.14 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741416  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2905  H-NS histone family protein  38.14 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0048  H-NS histone family protein  38.14 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1558  H-NS histone family protein  46 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.752713  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3155  H-NS histone family protein  38.14 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3404  H-NS histone family protein  38.14 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237819  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2965  H-NS histone family protein  38.14 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3909  H-NS histone family protein  38.14 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3827  H-NS histone family protein  38.14 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0209  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.11 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.726678 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0099  H-NS histone family protein  43.43 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0175  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.92 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3351  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  45.92 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.383074 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  46.94 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0162  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.92 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121985  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0195  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.11 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750004  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.39 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0088  DNA-binding protein BprA  43.43 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2714  DNA-binding protein BprA  41.05 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344106  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3224  DNA-binding protein BprA  43.43 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0263  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.11 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2825  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  37.11 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0281  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.11 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166699  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6382  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  41 
 
 		 589 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493779  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0126  H-NS histone family protein  42.42 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0208  H-NS histone family protein  42.42 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00707733  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3384  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  36.08 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1616  H-NS histone family protein  42.42 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2686  H-NS histone family protein  41.67 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3189  H-NS histone family protein  45.36 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0864  H-NS histone family protein  41.67 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4282  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.39 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0105949  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1784  H-NS histone family protein  41.67 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1623  H-NS histone family protein  41.67 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0489  H-NS histone family protein  41.67 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2858  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  45.92 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.259744  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1386  H-NS histone family protein  41.67 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0668  H-NS histone family protein  41.67 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0958724  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6191  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.4 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0249  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.92 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0231  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.92 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1601  putative DNA-binding protein  41.67 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.57 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.57 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0720  H-NS histone family protein  42.42 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232457  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1247  H-NS histone family protein  42.42 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2442  H-NS histone family protein  43 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1706  H-NS histone family protein  42.42 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5922  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.4 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.997127  normal  0.678214 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0742  H-NS histone family protein  42.42 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1174  H-NS histone family protein  42.42 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>