29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4866 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4866  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  222  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373863  hitchhiker  0.000131644 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4350  hypothetical protein  98.15 
 
 		 108 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000333846 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5371  hypothetical protein  94.44 
 
 		 108 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.059612  normal  0.0608107 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3451  hypothetical protein  94.44 
 
 		 108 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.22431  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4915  hypothetical protein  94.44 
 
 		 108 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424589  normal  0.380404 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0776  hypothetical protein  91.67 
 
 		 108 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43126  normal  0.0318592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3697  hypothetical protein  87.04 
 
 		 108 aa  200  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.571902  normal  0.383858 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2212  hypothetical protein  71.3 
 
 		 108 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00311977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0870  putative immunity protein  71.3 
 
 		 108 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0962  putative immunity protein  71.3 
 
 		 108 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.116631  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0833  putative immunity protein  68.75 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1567  putative immunity protein  68.75 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0224481  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0053  putative immunity protein  68.75 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.013055  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1762  immunity protein, putative  73.15 
 
 		 108 aa  153  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0454984  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5458  hypothetical protein  52 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5275  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124042  normal  0.0618607 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1149  hypothetical protein  53.19 
 
 		 102 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5534  putative signal peptide transmembrane protein  40.91 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089855 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6998  putative signal peptide transmembrane protein  42.86 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4104  hypothetical protein  48.89 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2874  putative signal peptide transmembrane protein  42.86 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1348  hypothetical protein  38.6 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.195078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1576  immunity protein, putative  38.78 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3368  hypothetical protein  36.92 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_42  hypothetical protein  39.13 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000133403  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1622  hypothetical protein  32 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.877447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4324  hypothetical protein  38.71 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0039  hypothetical protein  36.96 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1591  hypothetical protein  34.62 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000431403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>