25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4263 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4263  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  156  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60451  normal  0.208166 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5971  hypothetical protein  84.15 
 
 		 82 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.625335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4238  hypothetical protein  80.72 
 
 		 94 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3797  hypothetical protein  96.34 
 
 		 82 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.77906  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4384  hypothetical protein  81.71 
 
 		 82 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153963  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3983  hypothetical protein  81.71 
 
 		 82 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.88036  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1636  hypothetical protein  79.27 
 
 		 82 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.193369 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3134  hypothetical protein  64.71 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.542099  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3007  hypothetical protein  64.71 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1355  hypothetical protein  64.71 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5286  hypothetical protein  43.14 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1357  hypothetical protein  61.76 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5620  hypothetical protein  61.76 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0953084 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6472  hypothetical protein  61.76 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0520534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1328  hypothetical protein  44.44 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2719  normal  0.0317001 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6351  hypothetical protein  61.76 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.67537 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6061  hypothetical protein  61.76 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.701238  normal  0.166121 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5699  hypothetical protein  47.73 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.023839 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7016  hypothetical protein  64.29 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5466  hypothetical protein  55.88 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674724 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1694  hypothetical protein  57.14 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.272098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5288  hypothetical protein  57.14 
 
 		 60 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0365  hypothetical protein  66.67 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784229  normal  0.351551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0071  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0079  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.860546  normal  0.390037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>