More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3957 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3957  chemotaxis-specific methylesterase  100 
 
 
334 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879381  normal  0.466399 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3450  chemotaxis-specific methylesterase  98.2 
 
 
334 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.093801 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2017  chemotaxis-specific methylesterase  95.21 
 
 
334 aa  590  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393768  normal  0.593059 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3469  chemotaxis-specific methylesterase  94.01 
 
 
334 aa  587  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2009  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4056  chemotaxis-specific methylesterase  93.41 
 
 
334 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4310  chemotaxis-specific methylesterase  93.11 
 
 
334 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4534  chemotaxis-specific methylesterase  91.02 
 
 
334 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231919  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5390  chemotaxis-specific methylesterase  71.26 
 
 
338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.875858 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221.1  chemotaxis-specific methylesterase  67.56 
 
 
342 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0963  chemotaxis-specific methylesterase  67.56 
 
 
342 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1600  chemotaxis-specific methylesterase  67.56 
 
 
342 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.35285  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0506  chemotaxis-specific methylesterase  68.15 
 
 
342 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18332  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0259  chemotaxis-specific methylesterase  67.56 
 
 
342 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2537  chemotaxis-specific methylesterase  67.56 
 
 
342 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2682  chemotaxis-specific methylesterase  67.56 
 
 
342 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1403  chemotaxis-specific methylesterase  67.56 
 
 
342 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3732  chemotaxis-specific methylesterase  66.08 
 
 
339 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.748057 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3684  chemotaxis-specific methylesterase  67.58 
 
 
339 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.988422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2303  chemotaxis-specific methylesterase  66.97 
 
 
339 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.268254  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4571  chemotaxis-specific methylesterase  66.08 
 
 
339 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5518  chemotaxis-specific methylesterase  67.58 
 
 
339 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840599  normal  0.415497 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3792  chemotaxis-specific methylesterase  66.08 
 
 
339 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.662228  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4941  chemotaxis-specific methylesterase  67.07 
 
 
341 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.495065  normal  0.958006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3974  chemotaxis-specific methylesterase  65.87 
 
 
338 aa  384  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1435  chemotaxis-specific methylesterase  58.43 
 
 
335 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16480  chemotaxis-specific methylesterase  58.13 
 
 
335 aa  355  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00306037  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4229  chemotaxis-specific methylesterase  59.04 
 
 
337 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1493  chemotaxis-specific methylesterase  59.04 
 
 
337 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0242161  normal  0.820579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1057  chemotaxis-specific methylesterase  56.85 
 
 
336 aa  346  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1098  chemotaxis-specific methylesterase  57.23 
 
 
337 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1308  chemotaxis-specific methylesterase  57.1 
 
 
336 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4125  chemotaxis-specific methylesterase  57.23 
 
 
337 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.893624  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1498  protein-glutamate methylesterase CheB  56.19 
 
 
336 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3803  chemotaxis-specific methylesterase  49.71 
 
 
349 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3754  chemotaxis-specific methylesterase  49.71 
 
 
349 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3968  chemotaxis-specific methylesterase  59.39 
 
 
338 aa  316  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000938387  hitchhiker  0.00993796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1521  chemotaxis-specific methylesterase  48.48 
 
 
334 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3648  chemotaxis-specific methylesterase  58.48 
 
 
341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0832  chemotaxis-specific methylesterase  46.11 
 
 
355 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.078608  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2467  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  37.89 
 
 
369 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272955  normal  0.0644131 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2403  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.57 
 
 
361 aa  202  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.76 
 
 
369 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2383  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.42 
 
 
369 aa  199  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0658  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.59 
 
 
340 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113943  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0109  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.04 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2358  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.46 
 
 
342 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2187  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.39 
 
 
355 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0334  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  35.47 
 
 
355 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0727  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.77 
 
 
360 aa  192  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.941174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0034  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.21 
 
 
382 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.83 
 
 
353 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4208  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.85 
 
 
377 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.112955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0253  chemotaxis-specific methylesterase  38.28 
 
 
349 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0245  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.18 
 
 
355 aa  188  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134095  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2366  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.94 
 
 
352 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.73319  hitchhiker  0.0000774303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5454  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.21 
 
 
355 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.48 
 
 
347 aa  186  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0615  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.63 
 
 
347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0496998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0765  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.85 
 
 
367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0791  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.85 
 
 
367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02180  chemotaxis-specific methylesterase  37.54 
 
 
349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.447797 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0807  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.53 
 
 
347 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0880  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.06 
 
 
358 aa  180  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  35.47 
 
 
356 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2840  protein-glutamate methylesterase  37.58 
 
 
361 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3066  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.58 
 
 
361 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.979529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2817  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.14 
 
 
364 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3304  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.43 
 
 
344 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.836526  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.95 
 
 
340 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3079  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.4 
 
 
362 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0293  protein-glutamate methylesterase  34.83 
 
 
362 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279829  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3196  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.18 
 
 
346 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.287158 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  34.12 
 
 
344 aa  176  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.93 
 
 
339 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.33 
 
 
376 aa  176  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00461138  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  33.82 
 
 
344 aa  176  7e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2711  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.6 
 
 
347 aa  175  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1150  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.89 
 
 
367 aa  175  8e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149663  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0248  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.25 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.185703  normal  0.030578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00415  chemotaxis-specific methylesterase  34.34 
 
 
348 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0046  chemotaxis-specific methylesterase  31.73 
 
 
345 aa  172  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000324346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4423  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.77 
 
 
357 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0182  protein-glutamate methylesterase  34.1 
 
 
345 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0908  protein-glutamate methylesterase CheB  33.99 
 
 
358 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0656  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.41 
 
 
346 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000622897 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0648  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.29 
 
 
341 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1148  chemotaxis-specific methylesterase  34.63 
 
 
359 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.870616  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1406  two component CheB methylesterase  34.63 
 
 
363 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.890909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0639  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.29 
 
 
341 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3269  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  33.81 
 
 
357 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  0.000350875 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3945  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36 
 
 
358 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2242  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.04 
 
 
349 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.109495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0994  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.7 
 
 
346 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  37.08 
 
 
353 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1843  chemotaxis-specific methylesterase  36.49 
 
 
357 aa  170  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.426173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  36.94 
 
 
359 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4029  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.57 
 
 
358 aa  168  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000141988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2958  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.58 
 
 
361 aa  169  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2298  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.53 
 
 
338 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.981818  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2359  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.04 
 
 
349 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289939  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>