43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3920 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3920  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0130172  normal  0.782299 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3413  hypothetical protein  94.85 
 
 
194 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.331521 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2070  hypothetical protein  82.11 
 
 
194 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0397168  normal  0.75673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3511  hypothetical protein  79.47 
 
 
194 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432685 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4013  hypothetical protein  78.42 
 
 
194 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4353  hypothetical protein  78.42 
 
 
194 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605734  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4571  hypothetical protein  77.32 
 
 
193 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1824  protein of unknown function DUF1089  42.28 
 
 
192 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00397249  normal  0.0794049 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3663  hypothetical protein  38.99 
 
 
184 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4123  protein of unknown function DUF1089  32.95 
 
 
182 aa  92.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2999  hypothetical protein  39.88 
 
 
190 aa  92.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4875  protein of unknown function DUF1089  38.96 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000355198  normal  0.582407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1793  hypothetical protein  37.66 
 
 
184 aa  87.8  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0982203  hitchhiker  0.0000201517 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1188  hypothetical protein  38.26 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0444931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38720  hypothetical protein  39.29 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3366  hypothetical protein  36.36 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000501118  hitchhiker  0.0000000000000170165 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3300  hypothetical protein  38.57 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3333  hypothetical protein  34.81 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0237179  normal  0.179396 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4015  hypothetical protein  36.42 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.700649 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4072  hypothetical protein  35.37 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4530  hypothetical protein  34.76 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.16706 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0025  hypothetical protein  34.31 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1141  hypothetical protein  35.58 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.167433 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0568  hypothetical protein  35.81 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0294  hypothetical protein  35.81 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0164483  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1312  hypothetical protein  35.81 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2515  hypothetical protein  35.81 
 
 
410 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1260  hypothetical protein  35.81 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.928683  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1333  hypothetical protein  35.14 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.349732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1328  protein of unknown function DUF1089  38.51 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0834165  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4678  hypothetical protein  33.77 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376007  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3690  hypothetical protein  33.77 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2652  hypothetical protein  34.46 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4603  protein of unknown function DUF1089  29.09 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1479  hypothetical protein  35.14 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5622  hypothetical protein  33.77 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0317  protein of unknown function DUF1089  31.77 
 
 
200 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103976  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3293  hypothetical protein  26.19 
 
 
195 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5344  hypothetical protein  26.23 
 
 
200 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116261  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5051  hypothetical protein  26.23 
 
 
200 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.622775  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4963  hypothetical protein  26.23 
 
 
200 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.601635  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13787  hypothetical protein  28.96 
 
 
199 aa  42  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0307  protein of unknown function DUF1089  26.57 
 
 
184 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>