21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1864 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1864  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 396 aa  794    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.105748  hitchhiker  0.00576569 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1937  TPR repeat-containing protein  97.98 
 
 		 396 aa  624  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5261  TPR repeat-containing protein  83.63 
 
 		 388 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1319  TPR repeat-containing protein  88.66 
 
 		 415 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364479 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1974  TPR repeat-containing protein  84.67 
 
 		 393 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0922942 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6129  TPR repeat-containing protein  85.68 
 
 		 393 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1950  TPR repeat-containing protein  85.68 
 
 		 393 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2520  hypothetical protein  61.71 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1271  TPR repeat-containing protein  61.95 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2414  TPR repeat-containing protein  61.71 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.460414  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2372  TPR repeat-containing protein  61.71 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171384  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3311  hypothetical protein  61.95 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00468101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1999  hypothetical protein  61.71 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2080  hypothetical protein  62.84 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1499  hypothetical protein  61.71 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1271  TPR repeat-containing protein  61.08 
 
 		 407 aa  362  8e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2299  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.5 
 
 		 405 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.660517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1958  TPR repeat-containing protein  57.14 
 
 		 403 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0934824  normal  0.0827331 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2725  TPR repeat-containing protein  36.09 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1304  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.247714  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0331  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 		 349 aa  49.7  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>