17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0247 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0247  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363741 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3419  hypothetical protein  84.38 
 
 
86 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0320  hypothetical protein  85.94 
 
 
86 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0300  hypothetical protein  85.94 
 
 
64 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.65846  hitchhiker  0.0000893118 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2786  hypothetical protein  84.38 
 
 
86 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3107  hypothetical protein  54.39 
 
 
66 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0222  hypothetical protein  89.36 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.358976  hitchhiker  0.000000865535 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0239  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2867  hypothetical protein  61.9 
 
 
62 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000126648 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1973  hypothetical protein  60.98 
 
 
65 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3526  hypothetical protein  60.98 
 
 
65 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3785  hypothetical protein  60.98 
 
 
65 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0017  putative outer membrane protein  60.98 
 
 
65 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3121  hypothetical protein  60.98 
 
 
65 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0002  putative outer membrane protein  60.98 
 
 
65 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416146  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3672  hypothetical protein  57.45 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127877  hitchhiker  0.0000000499133 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3846  hypothetical protein  58.54 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>