40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0040 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0040  ISPsy18, transposase  100 
 
 
54 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.650148  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3172  transposase mutator type  87.88 
 
 
416 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4451  transposase mutator type  87.88 
 
 
416 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0007  transposase mutator type  87.88 
 
 
416 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0089  transposase mutator type  87.88 
 
 
416 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0255  transposase mutator type  87.88 
 
 
416 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0720  transposase mutator type  87.88 
 
 
416 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.208766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1272  transposase mutator type  87.88 
 
 
416 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.437771 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3752  transposase, mutator type  87.88 
 
 
416 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1179  transposase, mutator type  87.88 
 
 
416 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4611  transposase, mutator type  87.88 
 
 
416 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0700  transposase, mutator type  87.88 
 
 
416 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3142  transposase mutator type  87.88 
 
 
416 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.394881  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4528  transposase mutator family protein  81.82 
 
 
416 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4860  hypothetical protein  84.85 
 
 
115 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0478  ISRSO7-transposase protein  84.85 
 
 
416 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0252  ISRSO7-transposase protein  84.85 
 
 
416 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1812  transposase mutator type  87.5 
 
 
416 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.39638 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5785  transposase mutator type  87.5 
 
 
416 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2268  transposase, mutator type  84.38 
 
 
416 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1503  transposase, mutator type  84.38 
 
 
416 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430758  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1262  transposase, mutator type  84.38 
 
 
416 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.0250992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0480  transposase, mutator type  84.38 
 
 
416 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.690571  normal  0.698094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2200  transposase  69.7 
 
 
419 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0638  transposase  69.7 
 
 
419 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0568  transposase  69.7 
 
 
419 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0158  transposase  69.7 
 
 
419 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.590957  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1219  ISMca5, transposase  72.73 
 
 
411 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0428861  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0027  ISMca5, transposase  72.73 
 
 
411 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0270  putative transposase  70.97 
 
 
162 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3315  transposase mutator type  69.7 
 
 
415 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  52.63 
 
 
425 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  52.63 
 
 
425 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  52.63 
 
 
425 aa  42.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  52.63 
 
 
425 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  52.63 
 
 
425 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3783  transposase, mutator type  54.55 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000372197  decreased coverage  0.000919258 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  54.55 
 
 
426 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  54.55 
 
 
426 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  54.55 
 
 
426 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>