More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0334 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3450  isoleucyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 959 aa  859    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.132168  normal  0.319354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 938 aa  810    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 938 aa  811    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 944 aa  773    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 923 aa  724    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 943 aa  826    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 		 916 aa  638    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 939 aa  784    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2458  isoleucyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 960 aa  850    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0967  isoleucyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 945 aa  884    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 921 aa  665    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 953 aa  753    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3229  isoleucyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 944 aa  847    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1740  isoleucyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 953 aa  842    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3046  isoleucyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 946 aa  857    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490165  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 940 aa  787    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0806  isoleucyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 943 aa  839    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 921 aa  668    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 921 aa  668    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2658  isoleucyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 945 aa  885    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.763386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 921 aa  665    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2242  isoleucyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 945 aa  885    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0963  isoleucyl-tRNA synthetase  99.08 
 
 		 967 aa  1894    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0999  isoleucyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 931 aa  775    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0968  isoleucyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 931 aa  771    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 938 aa  665    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0710  isoleucyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 943 aa  836    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0257753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 941 aa  748    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 932 aa  898    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1033  isoleucyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 945 aa  885    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2745  isoleucyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 974 aa  856    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 940 aa  794    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 929 aa  931    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1892  isoleucyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 946 aa  780    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1783  isoleucyl-tRNA synthetase  99.9 
 
 		 973 aa  1951    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1122  isoleucyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 945 aa  883    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0334  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 973 aa  1952    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.765747  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 940 aa  800    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4852  isoleucyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 943 aa  827    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 919 aa  669    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 927 aa  704    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5844  isoleucyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 945 aa  884    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 931 aa  695    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0971  isoleucyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 945 aa  885    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.581767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 923 aa  734    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 934 aa  653    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 943 aa  748    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 921 aa  668    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1869  isoleucyl-tRNA synthetase  99.08 
 
 		 967 aa  1895    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.478653  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3399  isoleucyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 951 aa  848    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.93279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 908 aa  665    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 943 aa  963    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0415  isoleucyl-tRNA synthetase  98.25 
 
 		 989 aa  1868    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.686118  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 930 aa  648    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0770  isoleucyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 945 aa  886    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 946 aa  675    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 924 aa  704    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0584  isoleucyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 948 aa  789    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 931 aa  689    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0214  isoleucyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 949 aa  777    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000786038  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1432  isoleucyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 975 aa  832    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 932 aa  785    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0644  isoleucyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 943 aa  830    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2208  isoleucyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 934 aa  838    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3849  isoleucyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 943 aa  839    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.471166  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0807  isoleucyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 945 aa  872    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 943 aa  789    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0953  isoleucyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 943 aa  822    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.344865 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1277  isoleucyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 917 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0481  isoleucyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 946 aa  845    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1059  isoleucyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 940 aa  789    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131865  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 947 aa  750    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2885  isoleucyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 959 aa  851    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.461357  normal  0.170399 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 938 aa  765    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1861  isoleucyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 936 aa  637    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4230  isoleucyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 940 aa  789    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0354153  hitchhiker  0.0000563381 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0227  isoleucyl-tRNA synthetase  99.08 
 
 		 967 aa  1894    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.376879  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1901  isoleucyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 945 aa  882    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.580041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 942 aa  771    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2109  isoleucyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 945 aa  821    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 937 aa  770    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2112  isoleucyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 945 aa  885    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 940 aa  785    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 940 aa  784    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 941 aa  798    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 943 aa  777    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 927 aa  661    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 940 aa  785    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2559  isoleucyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 		 945 aa  877    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 943 aa  856    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4313  isoleucyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 924 aa  717    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.375273  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1252  isoleucyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 917 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1373  isoleucyl-tRNA synthetase  99.08 
 
 		 967 aa  1894    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636363  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 941 aa  791    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 940 aa  801    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2512  isoleucyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 945 aa  882    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0334302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 939 aa  768    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 928 aa  725    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 954 aa  692    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 940 aa  784    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>