101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0017 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0017  putative lipoprotein  100 
 
 
119 aa  243  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318965  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1416  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  243  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1503  ATP/GTP binding protein  99.16 
 
 
119 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.061401  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1184  hypothetical protein  98.32 
 
 
119 aa  239  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.274213  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0143  hypothetical protein  98.32 
 
 
119 aa  239  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0425687  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0422  hypothetical protein  98.32 
 
 
119 aa  239  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388111  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1157  hypothetical protein  98.32 
 
 
119 aa  239  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1384  hypothetical protein  84.03 
 
 
119 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00275643  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5368  Secreted repeat of unknown function  59.13 
 
 
120 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.80855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0732  hypothetical protein  58.82 
 
 
119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0969  putative lipoprotein  57.14 
 
 
119 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464868  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3018  Secreted repeat of unknown function  54.62 
 
 
119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.085278  normal  0.0254984 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0371  hypothetical protein  59.17 
 
 
119 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0898922  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0853  hypothetical protein  59.17 
 
 
119 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3942  hypothetical protein  55.83 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611037  normal  0.0334852 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0824  hypothetical protein  59.82 
 
 
119 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.011265  hitchhiker  0.00036805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2984  hypothetical protein  54.64 
 
 
148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2915  Secreted repeat of unknown function  51.55 
 
 
142 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2756  Secreted repeat of unknown function  57.58 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2535  hypothetical protein  64.52 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492129  normal  0.124515 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3262  Secreted repeat of unknown function  51.55 
 
 
142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.448223  normal  0.363807 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0726  hypothetical protein  62.77 
 
 
141 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0234947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1655  transmembrane protein  47.37 
 
 
125 aa  107  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000107151  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0743  hypothetical protein  60.18 
 
 
119 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0135792 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5217  Secreted repeat of unknown function  47.9 
 
 
123 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0830561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3281  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0852  Secreted repeat of unknown function  45.04 
 
 
130 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4610  hypothetical protein  46.34 
 
 
126 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1476  hypothetical protein  46.34 
 
 
126 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640223  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3144  hypothetical protein  41.18 
 
 
147 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302781  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2547  hypothetical protein  47.41 
 
 
161 aa  99.4  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0155  hypothetical protein  47.58 
 
 
123 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.70289 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1064  hypothetical protein  52.58 
 
 
126 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.581294  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0520  hypothetical protein  42.86 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6204  hypothetical protein  47.83 
 
 
164 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0594792  normal  0.0269002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5259  hypothetical protein  52.58 
 
 
127 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.189638  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1744  Secreted repeat of unknown function  44.44 
 
 
134 aa  95.9  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5605  hypothetical protein  49.04 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682246  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0589  hypothetical protein  49.47 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.614178  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2323  hypothetical protein  49.47 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0880  hypothetical protein  49.47 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1103  hypothetical protein  49.47 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1017  hypothetical protein  49.47 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1847  hypothetical protein  49.47 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.155582  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1696  hypothetical protein  47.96 
 
 
124 aa  93.6  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1653  hypothetical protein  49.47 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4292  hypothetical protein  47.96 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.608026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70740  hypothetical protein  47.47 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6136  hypothetical protein  47.47 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2753  Secreted repeat of unknown function  50.5 
 
 
131 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5319  secreted repeat of unknown function  42.74 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0220667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5227  hypothetical protein  41.94 
 
 
123 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.423904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4051  hypothetical protein  45.92 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4315  hypothetical protein  45.92 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3202  hypothetical protein  45.92 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3731  hypothetical protein  42.37 
 
 
124 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4205  hypothetical protein  41.53 
 
 
124 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616061  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3787  hypothetical protein  50 
 
 
129 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5366  hypothetical protein  46.3 
 
 
114 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.965277  normal  0.371852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3003  hypothetical protein  48.54 
 
 
138 aa  87  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0100135  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3375  hypothetical protein  45.74 
 
 
127 aa  83.6  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.770936  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2553  hypothetical protein  46.32 
 
 
121 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3263  hypothetical protein  41.27 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.745389  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3032  Secreted repeat of unknown function  40.5 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000392899  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1255  Secreted repeat of unknown function  46.32 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0504542  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2027  Secreted repeat of unknown function  37.5 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2209  hypothetical protein  39.39 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1918  hypothetical protein  39.39 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00969066  hitchhiker  0.000868214 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0456  hypothetical protein  38.05 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4389  hypothetical protein  40.71 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2521  Secreted repeat of unknown function  40.2 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3396  hypothetical protein  44.71 
 
 
126 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1505  hypothetical protein  40.21 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0162675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1489  hypothetical protein  39.6 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.092152 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0163  hypothetical protein  40.35 
 
 
300 aa  73.9  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00555  hypothetical protein  35.59 
 
 
244 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2165  secreted repeat of unknown function  40.22 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3511  Secreted repeat of unknown function  39.25 
 
 
182 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00420858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3790  hypothetical protein  38.18 
 
 
175 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1996  hypothetical protein  39.36 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.500109  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2780  Secreted repeat of unknown function  40.43 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3290  Secreted repeat of unknown function  42.16 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3560  Secreted repeat of unknown function  37.27 
 
 
277 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.166475  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2316  hypothetical protein  38.3 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546748  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2739  Secreted repeat of unknown function  37.5 
 
 
191 aa  67  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0867098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0147  hypothetical protein  41.18 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129961  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4095  Secreted repeat of unknown function  38.32 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.170148  normal  0.698481 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0063  hypothetical protein  38 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0083  secreted repeat of unknown function  38.24 
 
 
175 aa  61.2  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0647  Secreted repeat of unknown function  37 
 
 
295 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4888  Secreted repeat of unknown function  31.78 
 
 
281 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5084  secreted repeat of unknown function  35 
 
 
292 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.182852  normal  0.686692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0398  Secreted repeat of unknown function  39.22 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.473291  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1439  Secreted repeat of unknown function  31.45 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0050  secreted repeat of unknown function  37.5 
 
 
221 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2096  Secreted repeat of unknown function  34.31 
 
 
195 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.251561  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0027  hypothetical protein  37.25 
 
 
200 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3360  Secreted repeat of unknown function  33.33 
 
 
189 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5354  hypothetical protein  31.9 
 
 
196 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531773  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2418  Secreted repeat of unknown function  31.37 
 
 
461 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>