More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3396 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2723  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  82.6 
 
 
370 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0278  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  99.48 
 
 
383 aa  787    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0665  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  90.03 
 
 
391 aa  712    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2364  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  99.48 
 
 
383 aa  787    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2544  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  99.48 
 
 
383 aa  787    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2821  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  83.79 
 
 
362 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0632832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3396  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  100 
 
 
383 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0617  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  92.72 
 
 
389 aa  712    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.452305  normal  0.496257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3784  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  89.9 
 
 
383 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2557  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  83.47 
 
 
370 aa  644    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0689  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  86.34 
 
 
383 aa  681    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3389  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  100 
 
 
383 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1257  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  94.3 
 
 
386 aa  749    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1140  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  99.48 
 
 
383 aa  787    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4010  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  87.05 
 
 
381 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2958  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  83.43 
 
 
359 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2967  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  83.47 
 
 
370 aa  645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.775442  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0214  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  90.28 
 
 
391 aa  689    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2686  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  93.22 
 
 
381 aa  710    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541362  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0591  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  91.21 
 
 
384 aa  718    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2545  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  85.31 
 
 
384 aa  671    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0698  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  90.28 
 
 
391 aa  689    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3354  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  99.74 
 
 
383 aa  789    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1796  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  74.65 
 
 
370 aa  567  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334328  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1513  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  73.82 
 
 
370 aa  564  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.702789 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3413  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  70.73 
 
 
370 aa  534  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3756  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  68.65 
 
 
384 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0387  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  70.19 
 
 
369 aa  532  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582851  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0431  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  68.38 
 
 
380 aa  528  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4068  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  68.78 
 
 
379 aa  529  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4559  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  67.1 
 
 
421 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.888392  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3566  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  66.92 
 
 
396 aa  528  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.786297  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4724  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  68.92 
 
 
378 aa  521  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3817  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  66.58 
 
 
394 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0804  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  69.11 
 
 
372 aa  508  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2115  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  66.2 
 
 
360 aa  508  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0297  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  67.03 
 
 
370 aa  504  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.188258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3291  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  65.76 
 
 
365 aa  480  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1212  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  65.03 
 
 
365 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0851  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  66.95 
 
 
358 aa  472  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2243  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  65 
 
 
363 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0143164  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1942  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  59.23 
 
 
372 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3358  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  58.89 
 
 
376 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3190  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  59.17 
 
 
376 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127789  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1612  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  59.12 
 
 
371 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1720  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  59.12 
 
 
371 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2851  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  59.12 
 
 
371 aa  444  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.602222 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2154  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.68 
 
 
368 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00771219  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3596  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.84 
 
 
374 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2022  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.29 
 
 
367 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339115  normal  0.173824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1869  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.68 
 
 
368 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2399  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.29 
 
 
370 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00300816  normal  0.0915996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1819  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  59 
 
 
374 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.12881 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01131  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  58.29 
 
 
368 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.457011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2514  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  58.29 
 
 
368 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0085264  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1296  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.29 
 
 
368 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4014  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  59 
 
 
374 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.152317  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1785  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  59.28 
 
 
371 aa  434  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2470  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.29 
 
 
368 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1253  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.29 
 
 
368 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.854018  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1992  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.29 
 
 
368 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.987691 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01139  hypothetical protein  58.29 
 
 
368 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.390847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1594  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.29 
 
 
368 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000779038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30150  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  57.84 
 
 
375 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1311  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.01 
 
 
368 aa  435  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.817312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1313  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.61 
 
 
368 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.626036  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1950  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.61 
 
 
368 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1335  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.61 
 
 
368 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0776821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2581  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  57.03 
 
 
375 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2132  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.61 
 
 
368 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1351  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.61 
 
 
368 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.573011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28360  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.77 
 
 
372 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1762  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  58.56 
 
 
392 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.31241  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3619  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  57.89 
 
 
374 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1646  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.33 
 
 
369 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2040  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  56.47 
 
 
391 aa  431  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.527359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2063  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  57.85 
 
 
370 aa  431  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.558348  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2444  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  57.89 
 
 
384 aa  428  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3418  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  57.89 
 
 
374 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2497  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  56.55 
 
 
371 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0646  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  56.04 
 
 
372 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.733011  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2062  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  55.52 
 
 
377 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000391472  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0954  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.22 
 
 
371 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02368  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  56.39 
 
 
369 aa  420  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00392033  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1828  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  55.07 
 
 
377 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.963946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3108  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  56.11 
 
 
371 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.112655  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1581  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyltransferase  56.51 
 
 
359 aa  417  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000264393  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1683  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  55.12 
 
 
383 aa  416  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.438884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4128  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  55.56 
 
 
371 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.184534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4139  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  55.56 
 
 
371 aa  413  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4625  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  55.56 
 
 
371 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.775059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1679  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  56.63 
 
 
372 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2538  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  54.44 
 
 
398 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0961  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  58.33 
 
 
398 aa  411  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000522791 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1603  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  54.5 
 
 
372 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000041777  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1678  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  54.5 
 
 
372 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00625352  normal  0.128723 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1712  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  56.63 
 
 
372 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.490837  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1747  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  54.5 
 
 
372 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4529  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  55.56 
 
 
372 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00179039  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0963  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  54.97 
 
 
367 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.410035  normal  0.0653928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>