26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2150 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2150  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2014  hypothetical protein  99.72 
 
 
360 aa  735    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0593301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1994  hypothetical protein  99.72 
 
 
360 aa  735    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0825004  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3704  methyltransferase type 12  38.24 
 
 
356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.486268  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0118  hypothetical protein  36.87 
 
 
350 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.454348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4836  Methyltransferase type 12  30.7 
 
 
332 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0034  hypothetical protein  20.13 
 
 
329 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1536  hypothetical protein  20.13 
 
 
329 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0048  SAM-dependent methyltransferases  20.13 
 
 
329 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.54394  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1181  hypothetical protein  19.81 
 
 
329 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1461  hypothetical protein  19.81 
 
 
329 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.89569  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0028  hypothetical protein  19.81 
 
 
329 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0034  hypothetical protein  19.81 
 
 
329 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.653046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0031  hypothetical protein  21.9 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0956  hypothetical protein  23.23 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719773  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1380  hypothetical protein  23.41 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.160264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1791  hypothetical protein  23.41 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0523505  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0423  hypothetical protein  23.41 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0221  hypothetical protein  23.41 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0373645  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0341  hypothetical protein  23.41 
 
 
414 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.484139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  28 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1987  Methyltransferase type 11  24.07 
 
 
335 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.791499  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2352  hypothetical protein  24.07 
 
 
335 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  27 
 
 
295 aa  43.1  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0598  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
223 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191676  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  21.6 
 
 
307 aa  42.7  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>