27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1586 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1586  hypothetical protein  100 
 
 
47 aa  91.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00446832  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1668  hypothetical protein  97.87 
 
 
47 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.63045  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  74.47 
 
 
565 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  74.47 
 
 
565 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  74.47 
 
 
565 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  74.47 
 
 
565 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  70.21 
 
 
563 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  72.34 
 
 
563 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  72.34 
 
 
559 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  63.83 
 
 
565 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  63.83 
 
 
565 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  59.57 
 
 
565 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  65.79 
 
 
442 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  56.1 
 
 
559 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  57.45 
 
 
557 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  54.55 
 
 
563 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  69.7 
 
 
566 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  54.17 
 
 
566 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  62.5 
 
 
575 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  62.5 
 
 
578 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  62.5 
 
 
580 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  58.33 
 
 
578 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  58.33 
 
 
578 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  58.33 
 
 
578 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  57.5 
 
 
578 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  58.82 
 
 
559 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  58.82 
 
 
507 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>