More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0505 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0602  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  99.62 
 
 
262 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.602337  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0876  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  99.62 
 
 
267 aa  527  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.462803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1918  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  99.62 
 
 
262 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0505  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  100 
 
 
262 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0918  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  99.24 
 
 
262 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.11344  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0018  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  99.24 
 
 
262 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0023  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  99.23 
 
 
261 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.39587  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0021  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  98.85 
 
 
261 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0017  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  99.23 
 
 
261 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1524  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  99.23 
 
 
261 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0021  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  99.23 
 
 
261 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1167  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  99.23 
 
 
261 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1447  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  99.23 
 
 
261 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2038  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  97.33 
 
 
262 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0019  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  97.3 
 
 
261 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5312  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  93.46 
 
 
261 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4526  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  92.69 
 
 
261 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.129874  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3167  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  93.46 
 
 
261 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5146  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  92.69 
 
 
261 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3125  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  92.69 
 
 
261 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4982  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  92.31 
 
 
261 aa  477  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5713  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  92.69 
 
 
261 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110704  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2236  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  91.22 
 
 
262 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5540  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  91.98 
 
 
262 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5865  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  91.22 
 
 
262 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2212  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  91.22 
 
 
262 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1065  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  91.22 
 
 
262 aa  471  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2250  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  90.46 
 
 
262 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2129  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  90.84 
 
 
262 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213864  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1393  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  88.08 
 
 
265 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0890604  hitchhiker  0.00200504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  87.4 
 
 
265 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1961  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  86.87 
 
 
265 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.616628  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02396  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  83.46 
 
 
261 aa  447  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4270  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  82.31 
 
 
261 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149446  normal  0.650814 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4380  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  82.31 
 
 
261 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209201  normal  0.21753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  74.42 
 
 
260 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1428  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  67.94 
 
 
266 aa  374  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.818194  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1592  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  68.58 
 
 
266 aa  375  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2236  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  69.88 
 
 
260 aa  371  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2264  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  69.88 
 
 
260 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2411  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  70.93 
 
 
260 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.520745  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  67.18 
 
 
260 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  67.18 
 
 
260 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5564  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  68.6 
 
 
260 aa  359  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1704  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  64.89 
 
 
265 aa  346  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0494  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.85 
 
 
260 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6202  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  68.85 
 
 
260 aa  338  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.554491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61 
 
 
259 aa  331  6e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.791092  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1324  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.14 
 
 
260 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.41 
 
 
258 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
253 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2696  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.41 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.85 
 
 
261 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.67 
 
 
261 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.85 
 
 
261 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1807  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.8 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.86 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.9 
 
 
261 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2311  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.22 
 
 
261 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146201  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.77 
 
 
260 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1544  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  41.31 
 
 
257 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0575047  normal  0.138596 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10310  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.02 
 
 
263 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.998138  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.84 
 
 
256 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1797  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.62 
 
 
260 aa  175  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0932  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.63 
 
 
260 aa  175  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733087  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2857  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.86 
 
 
265 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1342  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.31 
 
 
257 aa  175  8e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3770  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.82 
 
 
252 aa  174  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1436  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.47 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3482  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.67 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.059744  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.23 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734906  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2755  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.54 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137616  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.06 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.85 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3554  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.92 
 
 
262 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3432  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.15 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.296547 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.91 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6971  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.47 
 
 
263 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1887  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.92 
 
 
260 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0166984  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0081  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.92 
 
 
271 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.243269  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1750  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.23 
 
 
261 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594296  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  39.46 
 
 
263 aa  169  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3009  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.76 
 
 
261 aa  168  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0803108 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1825  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.47 
 
 
258 aa  168  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00469409  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0047  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.47 
 
 
277 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2860  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.98 
 
 
258 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.981149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1408  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.93 
 
 
281 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2343  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.62 
 
 
262 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.23 
 
 
265 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.79 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4591  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.93 
 
 
261 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1507  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.84 
 
 
257 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0183743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4687  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.23 
 
 
262 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.58 
 
 
258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448544  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4787  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0938  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.62 
 
 
261 aa  165  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4841  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.08 
 
 
251 aa  165  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1388  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.46 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>