18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3686 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3686  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  634    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0109  hypothetical protein  74.13 
 
 
305 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2728  hypothetical protein  75.81 
 
 
304 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0756893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0203  hypothetical protein  68.12 
 
 
316 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2494  hypothetical protein  63.25 
 
 
333 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4744  hypothetical protein  62.88 
 
 
304 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111943  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1182  hypothetical protein  58.71 
 
 
298 aa  368  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.6386  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1658  hypothetical protein  59.4 
 
 
305 aa  362  6e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2357  hypothetical protein  56.11 
 
 
302 aa  347  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0335886  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0867  hypothetical protein  60.59 
 
 
303 aa  344  1e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0890858  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1619  hypothetical protein  60.97 
 
 
314 aa  343  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.175531  normal  0.0226832 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2447  hypothetical protein  52.09 
 
 
363 aa  232  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.938237 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5360  hypothetical protein  37.7 
 
 
344 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0641445 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4314  hypothetical protein  33.71 
 
 
427 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5090  hypothetical protein  28.96 
 
 
423 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.948231  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5048  hypothetical protein  30.23 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0131682  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1538  hypothetical protein  29.38 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.292569  normal  0.943893 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_219  hypothetical protein  24.12 
 
 
316 aa  42.7  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>