More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0416 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0416  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 225 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0578  short chain dehydrogenase  99.56 
 
 		 225 aa  440  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0395  short chain dehydrogenase  99.56 
 
 		 225 aa  440  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0343  short chain dehydrogenase  93.33 
 
 		 225 aa  394  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0097  short chain dehydrogenase  96.92 
 
 		 227 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2011  short chain dehydrogenase  97.36 
 
 		 227 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3084  short chain dehydrogenase  97.36 
 
 		 227 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2276  short chain dehydrogenase  97.36 
 
 		 227 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2977  short chain dehydrogenase  78.22 
 
 		 225 aa  351  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2840  short chain dehydrogenase  78.22 
 
 		 225 aa  350  7e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal  0.858614 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2928  short chain dehydrogenase  77.33 
 
 		 225 aa  347  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2943  short chain dehydrogenase  77.33 
 
 		 225 aa  347  8e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2314  short chain dehydrogenase  77.33 
 
 		 225 aa  347  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0377  short chain dehydrogenase  76.44 
 
 		 225 aa  342  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.773672 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6271  short chain dehydrogenase  75.11 
 
 		 225 aa  341  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0460  short chain dehydrogenase  70.22 
 
 		 225 aa  321  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4256  short chain dehydrogenase  69.78 
 
 		 225 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0177  short chain dehydrogenase  67.56 
 
 		 225 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0139  short chain dehydrogenase  55.9 
 
 		 226 aa  244  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0107  short chain dehydrogenase  56.77 
 
 		 226 aa  243  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.950091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0133  short chain dehydrogenase  56.28 
 
 		 237 aa  241  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0125  short chain dehydrogenase  56.28 
 
 		 237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0275  short chain dehydrogenase  57.76 
 
 		 236 aa  224  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0287555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3775  short chain dehydrogenase  48.64 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3053  short chain dehydrogenase  49.32 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4186  short chain dehydrogenase  46.82 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4367  short chain dehydrogenase  47.93 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.29 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5986  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 233 aa  141  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002919  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 		 229 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  38.56 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2459  csgA protein  37.61 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.54228  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.14 
 
 		 232 aa  128  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 		 231 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4571  short chain dehydrogenase  35.81 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000728936  hitchhiker  0.00656486 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3702  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 		 227 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0637  short chain dehydrogenase  36.24 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000253756 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1469  short-chain dehydrogenase/reductase  35.32 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0632  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000159867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0592  short chain dehydrogenase  34.36 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3390  short chain dehydrogenase  34.96 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  34.91 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3129  short chain dehydrogenase  34.96 
 
 		 226 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0400  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  37.34 
 
 		 234 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0465203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.56 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0036356  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.77 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3270  short chain dehydrogenase  34.07 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0766  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.62 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  37.31 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.69 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0722078 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1888  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0670  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.620328  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0676  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  31.47 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1022  short chain dehydrogenase  40.6 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11130  short chain dehydrogenase  36.48 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.19 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.562749 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 		 238 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.53 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.53 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122274  normal  0.0405726 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2084  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 		 238 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0860576  normal  0.320515 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 228 aa  101  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.97281  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0232972  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.74 
 
 		 239 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12179  normal  0.661706 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.909495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.506179 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.19 
 
 		 235 aa  96.3  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.819367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0124  short chain dehydrogenase family protein  32.17 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.635136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2058  short chain dehydrogenase / reductase  33.63 
 
 		 221 aa  85.1  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.252145 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  31.28 
 
 		 219 aa  85.1  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3970  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000119913  decreased coverage  0.00103281 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0705  short-chain dehydrogenase/reductase  30.13 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.096337  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.138611  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07571  short-chain dehydrogenase/reductase  30.13 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  29.69 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0975  short-chain dehydrogenase/reductase  33.04 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.264766  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14521  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  30.87 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00155018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>