22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0017 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0017  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  260  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0019  hypothetical protein  94.07 
 
 
177 aa  214  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0021  hypothetical protein  94.07 
 
 
177 aa  214  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1445  hypothetical protein  94.07 
 
 
177 aa  214  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.280213  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1165  hypothetical protein  94.07 
 
 
177 aa  214  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0015  hypothetical protein  94.07 
 
 
135 aa  213  8e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1522  hypothetical protein  94.07 
 
 
135 aa  213  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0019  hypothetical protein  94.03 
 
 
177 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3123  hypothetical protein  65.93 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.862887 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4980  hypothetical protein  65.19 
 
 
154 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411596  normal  0.591894 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5314  hypothetical protein  66.42 
 
 
154 aa  166  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563959  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3169  hypothetical protein  68.15 
 
 
166 aa  166  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5148  hypothetical protein  66.67 
 
 
154 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.426334  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5711  hypothetical protein  66.67 
 
 
154 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0707183 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4528  hypothetical protein  66.67 
 
 
154 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151513  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1774  putative signal peptide transmembrane protein  38.06 
 
 
154 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120918  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1573  putative signal peptide transmembrane protein  38.06 
 
 
154 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182426  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2910  putative signal peptide transmembrane protein  38.81 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1345  hypothetical protein  29.81 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337158  normal  0.0274003 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5582  hypothetical protein  31.43 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1409  hypothetical protein  30.95 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000519507  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5305  hypothetical protein  29.63 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>