More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1169 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1169  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  528  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220613  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4434  transcriptional regulator, IclR family  56.2 
 
 		 261 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0001758  normal  0.639145 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3717  IclR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0598808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  29.1 
 
 		 253 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  28.28 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 260 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  26.02 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  26.02 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  26.02 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  26.02 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  26.02 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  26.02 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  26.02 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  26.02 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  30.14 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  30.63 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  30.63 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3511  IclR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 272 aa  99.4  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  unclonable  0.00000000292695  hitchhiker  0.000232914 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 284 aa  99.8  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.79 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  27.8 
 
 		 254 aa  98.6  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.19 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  26.92 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  30.45 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  25.21 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.55 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 274 aa  95.5  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  26.02 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  24.39 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.32 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  24.39 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  24.39 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  24.39 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  24.39 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  24.79 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  24.79 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  24.79 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  26.07 
 
 		 277 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  29.33 
 
 		 275 aa  93.2  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  26.83 
 
 		 260 aa  92.4  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  25.41 
 
 		 276 aa  92.4  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  25.64 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  28.35 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  29.05 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  29.05 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 260 aa  89.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 269 aa  89.4  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 269 aa  89  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0381  IclR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  25.91 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  28.75 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 279 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  27.91 
 
 		 294 aa  87  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  29.09 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  26.07 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 260 aa  85.1  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 280 aa  85.5  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.51 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  24.89 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  25.61 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  30.04 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  26.79 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2854  transcriptional regulator, IclR family  31.23 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  29.39 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  30.92 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  25 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  30.92 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  27.06 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  30.97 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  27.54 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  27.78 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>