29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0190 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009504  BOV_A0172    99.6 
 
 		 1238 bp  2409    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.018644  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0190    100 
 
 		 1239 bp  2456    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  86.92 
 
 		 1266 bp  111  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  78.17 
 
 		 1275 bp  97.6  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  82.09 
 
 		 1170 bp  75.8  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  82.5 
 
 		 1314 bp  71.9  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  95.35 
 
 		 1296 bp  69.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  89.09 
 
 		 1248 bp  61.9  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  82.54 
 
 		 1272 bp  60  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213.1  glucose-galactose transporter  87.5 
 
 		 279 bp  56  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  96.88 
 
 		 1308 bp  56  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  92.5 
 
 		 1284 bp  56  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1420  major facilitator transporter  92.5 
 
 		 1404 bp  56  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  87.27 
 
 		 1248 bp  54  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  96.77 
 
 		 1311 bp  54  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  81.75 
 
 		 1272 bp  52  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  96.67 
 
 		 1287 bp  52  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  85.71 
 
 		 1272 bp  48.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  85.71 
 
 		 1296 bp  48.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  91.67 
 
 		 1374 bp  48.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1184    85.71 
 
 		 1296 bp  48.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  85.71 
 
 		 1296 bp  48.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  91.67 
 
 		 1374 bp  48.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  91.67 
 
 		 1374 bp  48.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  100 
 
 		 1302 bp  48.1  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  91.67 
 
 		 1374 bp  48.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  85.71 
 
 		 1296 bp  48.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2214    88.64 
 
 		 1050 bp  48.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  96.43 
 
 		 1290 bp  48.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>