81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1033 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1033  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  696    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0999  hypothetical protein  99.16 
 
 
357 aa  691    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2119  hypothetical protein  85.15 
 
 
360 aa  534  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1416  hypothetical protein  51.55 
 
 
354 aa  348  9e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2179  hypothetical protein  51.27 
 
 
359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117736  hitchhiker  0.00445962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1967  hypothetical protein  51.73 
 
 
359 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72287  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2471  hypothetical protein  50.14 
 
 
365 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1530  hypothetical protein  52.6 
 
 
361 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.466314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4271  hypothetical protein  46.38 
 
 
348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.990265 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3703  hypothetical protein  42.61 
 
 
364 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1771  hypothetical protein  42.86 
 
 
369 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3390  hypothetical protein  43.42 
 
 
348 aa  256  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244844  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3942  hypothetical protein  48.6 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32994  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3020  hypothetical protein  43.3 
 
 
348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6675  hypothetical protein  45.85 
 
 
342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3784  hypothetical protein  42.57 
 
 
336 aa  239  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.398301 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2136  hypothetical protein  43.97 
 
 
342 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.298918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1724  hypothetical protein  44.38 
 
 
344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2411  hypothetical protein  39.5 
 
 
363 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1784  hypothetical protein  42.78 
 
 
340 aa  222  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.385363 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2120  hypothetical protein  42.78 
 
 
340 aa  223  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3518  hypothetical protein  40.57 
 
 
355 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000767611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6217  hypothetical protein  50 
 
 
336 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24156  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7087  hypothetical protein  44.09 
 
 
337 aa  205  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2222  hypothetical protein  32.65 
 
 
351 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.457104 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0500  hypothetical protein  32.65 
 
 
352 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.150258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3464  hypothetical protein  39.03 
 
 
334 aa  169  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0569  hypothetical protein  32.94 
 
 
351 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0638  hypothetical protein  37.27 
 
 
369 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205162  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1936  hypothetical protein  35.32 
 
 
338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.394399  hitchhiker  0.0000381531 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2387  hypothetical protein  33.44 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0485  hypothetical protein  26.28 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3000  hypothetical protein  28.09 
 
 
358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.974261  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1533  hypothetical protein  26.94 
 
 
353 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2324  conserved hypothetical protein  26.94 
 
 
353 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2303  hypothetical protein  26.94 
 
 
353 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000471514  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1800  hypothetical protein  26.94 
 
 
353 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.824337  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1555  hypothetical protein  26.94 
 
 
353 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1967  hypothetical protein  26.94 
 
 
353 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.650951 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01310  hypothetical protein  26.94 
 
 
353 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00001579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1437  hypothetical protein  26.94 
 
 
353 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01299  hypothetical protein  26.94 
 
 
353 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00002208  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1421  membrane protein-like protein  28.74 
 
 
405 aa  99.4  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.667551  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2153  hypothetical protein  26.52 
 
 
349 aa  99  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2326  hypothetical protein  27.65 
 
 
347 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1648  hypothetical protein  26.12 
 
 
353 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000331531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1870  hypothetical protein  26.18 
 
 
353 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0539335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1610  hypothetical protein  27.99 
 
 
424 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2606  hypothetical protein  26.91 
 
 
347 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1809  hypothetical protein  26.12 
 
 
353 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.341639 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1726  hypothetical protein  27.89 
 
 
352 aa  93.2  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1466  hypothetical protein  26.12 
 
 
353 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.484539  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1808  hypothetical protein  25.77 
 
 
353 aa  92.8  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000894217 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1791  hypothetical protein  28.89 
 
 
353 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1899  hypothetical protein  28.89 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.12937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2532  hypothetical protein  28.89 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1621  hypothetical protein  27.71 
 
 
406 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.570654  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1644  hypothetical protein  27.1 
 
 
406 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1506  hypothetical protein  27.31 
 
 
410 aa  86.7  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0596  hypothetical protein  26.07 
 
 
357 aa  87  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2733  hypothetical protein  27.1 
 
 
406 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.47044  normal  0.16271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3768  hypothetical protein  25.7 
 
 
375 aa  86.3  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.427736  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0925  hypothetical protein  27.31 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2475  hypothetical protein  26.2 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1230  hypothetical protein  30 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1758  hypothetical protein  27.1 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003164  DUF697 domain-containing protein  23.57 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2618  hypothetical protein  26.37 
 
 
353 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.47564 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01918  hypothetical protein  23.66 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2574  hypothetical protein  24.92 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.828972  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2492  hypothetical protein  25.98 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0427055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1558  hypothetical protein  28.21 
 
 
368 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.947174  hitchhiker  0.000134961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00139  hypothetical protein  26.53 
 
 
382 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1811  hypothetical protein  24.35 
 
 
401 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3096  hypothetical protein  28.36 
 
 
365 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.361386  hitchhiker  0.000029211 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1241  hypothetical protein  26.16 
 
 
362 aa  54.7  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0326375 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2665  hypothetical protein  24.84 
 
 
370 aa  53.1  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.781372  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2644  hypothetical protein  26.2 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.582755 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1174  hypothetical protein  25.32 
 
 
322 aa  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2546  hypothetical protein  26.44 
 
 
400 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2478  hypothetical protein  26.35 
 
 
400 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>