11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0728 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0728  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  610  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.17737  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2085  hypothetical protein  32.02 
 
 		 218 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2087  hypothetical protein  32.56 
 
 		 240 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2539  hypothetical protein  30.61 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4751  hypothetical protein  32.5 
 
 		 230 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1193  hypothetical protein  32.52 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226627  normal  0.38143 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3215  hypothetical protein  27.23 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.732945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0457  hypothetical protein  33.08 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.631295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3209  hypothetical protein  28.87 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1425  hypothetical protein  26.04 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  27.88 
 
 		 205 aa  47  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>