18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0047 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009504  BOV_A0047    100 
 
 
383 bp  759    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0051  16 kDa heat shock protein A  96.76 
 
 
471 bp  541  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4279  heat shock protein Hsp20  85.76 
 
 
471 bp  272  7e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3321  heat shock protein Hsp20  82.32 
 
 
471 bp  103  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3620  heat shock protein Hsp20  93.75 
 
 
471 bp  95.6  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3739  small heat shock protein  90.91 
 
 
468 bp  83.8  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2715  heat shock protein Hsp20  91.38 
 
 
462 bp  75.8  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298562  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2746  heat shock protein Hsp20  87.14 
 
 
507 bp  67.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1373  small heat shock protein  90.38 
 
 
480 bp  63.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.272184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2891  heat shock protein Hsp20  92.86 
 
 
465 bp  60  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.457656  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3350  heat shock protein Hsp20  84.29 
 
 
519 bp  52  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4263  heat shock protein Hsp20  94.12 
 
 
504 bp  52  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4630  heat shock protein Hsp20  94.12 
 
 
489 bp  52  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127451  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  88.89 
 
 
471 bp  50.1  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  93.55 
 
 
438 bp  46.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0157  HSP20 family protein  96.3 
 
 
483 bp  46.1  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2821  heat shock protein Hsp20  87.23 
 
 
486 bp  46.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13645  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_004310  BR0163  HSP20 family protein  96.3 
 
 
483 bp  46.1  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>