More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2883 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0037  sigma-54 dependent transcriptional regulator  100 
 
 
462 aa  938    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0812  sigma-54 dependent transcriptional regulator  100 
 
 
462 aa  938    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1809  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  77.88 
 
 
463 aa  723    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2883  sigma-54 dependent transcriptional regulator  100 
 
 
462 aa  938    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71369  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2202  sigma-54 dependent transcriptional regulator  99.77 
 
 
443 aa  900    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0673896  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0526  sigma-54 dependent transcriptional regulator  97.19 
 
 
462 aa  909    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888522  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2505  sigma-54 dependent transcriptional regulator  100 
 
 
462 aa  938    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4396  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  79.46 
 
 
463 aa  730    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0978866  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3308  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  79.01 
 
 
463 aa  734    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0636  sigma-54 dependent transcriptional regulator  99.78 
 
 
462 aa  936    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0650  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  99.57 
 
 
462 aa  933    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614366  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4157  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  79.01 
 
 
463 aa  734    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4106  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  78.78 
 
 
463 aa  728    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257345  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3632  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  78.78 
 
 
463 aa  728    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0660545  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4209  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  79.01 
 
 
463 aa  734    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0604018  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0787  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  61.87 
 
 
464 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1029  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  62.47 
 
 
464 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2955  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  62.24 
 
 
464 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.483673  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1679  sigma-54 dependent DNA-binding transcriptional regulator  59.6 
 
 
461 aa  531  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5342  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  59.63 
 
 
454 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0898  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  59.05 
 
 
461 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0383  sigma-54 dependent DNA-binding transcriptional regulator  59.05 
 
 
461 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29436  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2947  sigma-54 dependent DNA-binding transcriptional regulator  59.05 
 
 
461 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2834  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  59.05 
 
 
461 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2896  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  59.05 
 
 
461 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0250  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  59.05 
 
 
461 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2524  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  59.05 
 
 
461 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0964  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  58.47 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2219  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  58.73 
 
 
462 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4198  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  57.63 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1043  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  57.5 
 
 
465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.332951  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0605  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  57.5 
 
 
465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180483  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0960  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  58.47 
 
 
465 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1084  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  57.5 
 
 
465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2963  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  57.14 
 
 
522 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0352623  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1021  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  56.69 
 
 
464 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100583  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0783  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  56.88 
 
 
495 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.301138  normal  0.0118042 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2258  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  55.25 
 
 
493 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196111  decreased coverage  0.00780005 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3738  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  54.34 
 
 
490 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239334  normal  0.543617 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2841  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  55.96 
 
 
486 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2951  sigma-54 dependent DNA-binding transcriptional regulator  55.96 
 
 
486 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2901  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  55.96 
 
 
624 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.413973  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3687  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  54.79 
 
 
496 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.390992  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4525  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  54.79 
 
 
496 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5563  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  54.34 
 
 
490 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3839  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  54.79 
 
 
478 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00683049  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0386  sigma-54 dependent DNA-binding transcriptional regulator  55.73 
 
 
597 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.857446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2529  sigma-54 dependent DNA-binding transcriptional regulator  55.73 
 
 
619 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4903  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  54.79 
 
 
493 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.601565  hitchhiker  0.00038265 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0245  sigma-54 dependent DNA-binding transcriptional regulator  55.73 
 
 
607 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0902  sigma-54 dependent DNA-binding transcriptional regulator  55.73 
 
 
607 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1675  sigma-54 dependent DNA-binding transcriptional regulator  55.16 
 
 
629 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3777  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.9 
 
 
473 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0128705 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4207  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  54.2 
 
 
477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4730  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  52.76 
 
 
457 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.483899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0877  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.05 
 
 
473 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0936  sigma-54 dependent DNA-binding transcriptional regulator  52.39 
 
 
476 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266088  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5456  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.64 
 
 
473 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373718  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4827  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.41 
 
 
465 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115384  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3540  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.41 
 
 
465 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.4661  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5417  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  50.34 
 
 
478 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.938631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1030  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  51.32 
 
 
457 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255246  normal  0.215891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1186  putative sigma-54 interacting transcription regulator protein  50.96 
 
 
458 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.32993 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1122  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  50.82 
 
 
457 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5314  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  51.41 
 
 
502 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.213298  hitchhiker  0.00230622 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1183  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49.89 
 
 
479 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.167221  normal  0.634355 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5813  Fis family sigma54 specific transcriptional regulator  50.6 
 
 
500 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2632  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49.66 
 
 
457 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5337  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  52.04 
 
 
473 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0659  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  47.95 
 
 
458 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1911  two component sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.22 
 
 
446 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0604  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  47.74 
 
 
459 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109606  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2172  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.58 
 
 
463 aa  359  6e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1017  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  48.89 
 
 
482 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2769  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.7 
 
 
441 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.3551  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3503  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  46.56 
 
 
441 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.769801  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2426  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.56 
 
 
441 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154425  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2592  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.31 
 
 
441 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2273  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.56 
 
 
441 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0498  Fis family transcriptional regulator  40.5 
 
 
503 aa  343  5e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39360  putative sigma-54 dependent transcriptional regulator  49.18 
 
 
442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.718088 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0732  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  47.22 
 
 
455 aa  318  1e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2588  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  55.81 
 
 
351 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2970  sigma-54 factor, interaction region  43.32 
 
 
445 aa  310  4e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2498  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.69 
 
 
445 aa  309  8e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1992  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  50.48 
 
 
455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.139659  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1940  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  44.63 
 
 
455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0670  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.51 
 
 
453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1807  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.65 
 
 
454 aa  307  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2324  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.35 
 
 
466 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0534699  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2087  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.01 
 
 
451 aa  306  6e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.812028  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2958  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.13 
 
 
472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15472  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0197  two component Fis family transcriptional regulator  46.63 
 
 
449 aa  302  8.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2443  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.65 
 
 
454 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4130  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.38 
 
 
446 aa  300  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2438  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  47.74 
 
 
467 aa  300  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0850  two component Fis family transcriptional regulator  42.32 
 
 
462 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2047  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.67 
 
 
458 aa  296  4e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1152  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49.52 
 
 
488 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0888361  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1776  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.95 
 
 
456 aa  293  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>