50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0616 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0320    100 
 
 		 843 bp  1671    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  88.92 
 
 		 1377 bp  896    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  88.19 
 
 		 1374 bp  850    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  88 
 
 		 1377 bp  825    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0064    100 
 
 		 732 bp  1451    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.543215  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  99.53 
 
 		 1440 bp  1639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  99.76 
 
 		 1374 bp  1655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2450    100 
 
 		 732 bp  1451    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0616    100 
 
 		 843 bp  1671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  88.55 
 
 		 1377 bp  872    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  89.04 
 
 		 1377 bp  904    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  88.55 
 
 		 1377 bp  872    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  85.25 
 
 		 1410 bp  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  96.8 
 
 		 1374 bp  1457    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  88.15 
 
 		 1377 bp  837    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  99.76 
 
 		 1374 bp  1655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  85.46 
 
 		 1410 bp  599  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  85.53 
 
 		 1416 bp  507  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1141  xanthine permease  81.74 
 
 		 1473 bp  129  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  80.39 
 
 		 1401 bp  109  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  87.76 
 
 		 1410 bp  99.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1307  xanthine permease  80.09 
 
 		 1500 bp  93.7  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.225701  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  79.68 
 
 		 1410 bp  93.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  87.23 
 
 		 1407 bp  91.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  79.66 
 
 		 1488 bp  87.7  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  87.06 
 
 		 1449 bp  81.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  91.53 
 
 		 1428 bp  77.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  91.53 
 
 		 1428 bp  77.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2635    86.05 
 
 		 111 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  85.56 
 
 		 1407 bp  75.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0781  putative permease transmembrane protein  85.56 
 
 		 1602 bp  75.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.654089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  84.78 
 
 		 1401 bp  71.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  84.78 
 
 		 1401 bp  71.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  83.17 
 
 		 1398 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  85 
 
 		 1350 bp  63.9  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1034  xanthine permease  80.27 
 
 		 1488 bp  61.9  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581901  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2107  xanthine permease  80.27 
 
 		 1488 bp  61.9  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439445  normal  0.198609 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  90.2 
 
 		 1368 bp  61.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  88.68 
 
 		 1470 bp  58  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  92.68 
 
 		 1398 bp  58  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3343  xanthine permease  94.44 
 
 		 1410 bp  56  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  88.46 
 
 		 1458 bp  56  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1113  uracil-xanthine permease  79.59 
 
 		 1488 bp  54  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3668  xanthine permease  94.29 
 
 		 1410 bp  54  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0396635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5248  xanthine permease  92.11 
 
 		 1401 bp  52  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0717  xanthine permease  87.04 
 
 		 1509 bp  52  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  96.55 
 
 		 1392 bp  50.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  78.61 
 
 		 1485 bp  50.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1277  uracil-xanthine permease  91.67 
 
 		 1491 bp  48.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  87.5 
 
 		 1368 bp  48.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>