29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1281 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_1281  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 145 aa  230  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520882  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0874  60S ribosomal protein L19  60.16 
 
 		 304 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  96.61 
 
 		 449 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  88.57 
 
 		 473 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 442 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  100 
 
 		 442 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1970  hypothetical protein  95.65 
 
 		 50 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  92.68 
 
 		 550 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1424  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 439 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3532  AraC family transcriptional regulator  91.89 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.861802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3124  AraC family transcriptional regulator  91.89 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3787  AraC family transcriptional regulator  94.44 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2266  hypothetical protein  43.18 
 
 		 1250 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3109  AraC family transcriptional regulator  97.14 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03460  hypothetical protein  42 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2733  hypothetical protein  62.26 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000773119  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01346  hypothetical protein  44.44 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  75 
 
 		 485 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3848  AraC family transcriptional regulator  92.86 
 
 		 40 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.070471  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  37.93 
 
 		 2906 aa  47  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3863  pseudouridine synthase, Rsu  36.14 
 
 		 680 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.695211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1358  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 896 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.942872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  28 
 
 		 1186 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  27.2 
 
 		 1068 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  26.4 
 
 		 962 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  27.87 
 
 		 1012 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1807  hypothetical protein  32.26 
 
 		 330 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0569  hypothetical protein  52.5 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000273509  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2752  hypothetical protein  30.4 
 
 		 281 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.71434 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>